Protein–RNA interactions for Protein: Q15853

USF2, Upstream stimulatory factor 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USF2Q15853 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
USF2Q15853 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
USF2Q15853 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
USF2Q15853 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
USF2Q15853 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
USF2Q15853 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
USF2Q15853 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
USF2Q15853 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
USF2Q15853 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
USF2Q15853 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
USF2Q15853 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
USF2Q15853 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
USF2Q15853 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
USF2Q15853 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
USF2Q15853 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
USF2Q15853 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
USF2Q15853 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
USF2Q15853 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
USF2Q15853 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
USF2Q15853 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
USF2Q15853 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
USF2Q15853 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
USF2Q15853 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
USF2Q15853 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
USF2Q15853 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
USF2Q15853 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
USF2Q15853 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
USF2Q15853 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
USF2Q15853 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
USF2Q15853 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
USF2Q15853 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
USF2Q15853 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
USF2Q15853 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
USF2Q15853 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
USF2Q15853 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
USF2Q15853 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
USF2Q15853 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
USF2Q15853 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
USF2Q15853 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
USF2Q15853 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
USF2Q15853 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
USF2Q15853 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
USF2Q15853 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
USF2Q15853 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
USF2Q15853 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
USF2Q15853 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
USF2Q15853 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
USF2Q15853 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
USF2Q15853 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
USF2Q15853 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
USF2Q15853 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
USF2Q15853 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
USF2Q15853 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
USF2Q15853 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
USF2Q15853 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
USF2Q15853 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
USF2Q15853 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
USF2Q15853 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
USF2Q15853 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
USF2Q15853 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
USF2Q15853 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
USF2Q15853 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
USF2Q15853 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
USF2Q15853 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
USF2Q15853 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
USF2Q15853 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
USF2Q15853 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
USF2Q15853 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
USF2Q15853 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
USF2Q15853 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
USF2Q15853 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
USF2Q15853 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
USF2Q15853 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
USF2Q15853 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
USF2Q15853 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
USF2Q15853 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
USF2Q15853 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
USF2Q15853 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
USF2Q15853 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
USF2Q15853 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
USF2Q15853 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
USF2Q15853 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC18.75■□□□□ 0.59
USF2Q15853 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
USF2Q15853 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
USF2Q15853 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
USF2Q15853 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
USF2Q15853 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
USF2Q15853 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
USF2Q15853 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
USF2Q15853 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
USF2Q15853 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
USF2Q15853 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
USF2Q15853 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
USF2Q15853 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
USF2Q15853 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
USF2Q15853 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
USF2Q15853 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
USF2Q15853 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
USF2Q15853 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
USF2Q15853 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
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