Protein–RNA interactions for Protein: Q15797

SMAD1, Mothers against decapentaplegic homolog 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD1Q15797 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SMAD1Q15797 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SMAD1Q15797 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SMAD1Q15797 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
SMAD1Q15797 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SMAD1Q15797 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SMAD1Q15797 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
SMAD1Q15797 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
SMAD1Q15797 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SMAD1Q15797 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SMAD1Q15797 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SMAD1Q15797 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SMAD1Q15797 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SMAD1Q15797 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SMAD1Q15797 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SMAD1Q15797 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SMAD1Q15797 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SMAD1Q15797 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SMAD1Q15797 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SMAD1Q15797 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SMAD1Q15797 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SMAD1Q15797 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SMAD1Q15797 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SMAD1Q15797 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
SMAD1Q15797 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SMAD1Q15797 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
SMAD1Q15797 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SMAD1Q15797 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SMAD1Q15797 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SMAD1Q15797 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SMAD1Q15797 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SMAD1Q15797 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SMAD1Q15797 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SMAD1Q15797 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SMAD1Q15797 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SMAD1Q15797 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SMAD1Q15797 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SMAD1Q15797 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SMAD1Q15797 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
SMAD1Q15797 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SMAD1Q15797 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SMAD1Q15797 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SMAD1Q15797 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SMAD1Q15797 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SMAD1Q15797 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SMAD1Q15797 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SMAD1Q15797 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SMAD1Q15797 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SMAD1Q15797 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SMAD1Q15797 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SMAD1Q15797 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
SMAD1Q15797 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SMAD1Q15797 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SMAD1Q15797 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SMAD1Q15797 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SMAD1Q15797 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SMAD1Q15797 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
SMAD1Q15797 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
SMAD1Q15797 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SMAD1Q15797 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SMAD1Q15797 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SMAD1Q15797 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SMAD1Q15797 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SMAD1Q15797 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SMAD1Q15797 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SMAD1Q15797 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
SMAD1Q15797 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SMAD1Q15797 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SMAD1Q15797 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SMAD1Q15797 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SMAD1Q15797 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SMAD1Q15797 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
SMAD1Q15797 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SMAD1Q15797 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
SMAD1Q15797 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SMAD1Q15797 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SMAD1Q15797 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SMAD1Q15797 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SMAD1Q15797 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SMAD1Q15797 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SMAD1Q15797 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC24■■□□□ 1.43
SMAD1Q15797 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SMAD1Q15797 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SMAD1Q15797 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
SMAD1Q15797 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC24■■□□□ 1.43
SMAD1Q15797 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
SMAD1Q15797 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SMAD1Q15797 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SMAD1Q15797 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
SMAD1Q15797 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SMAD1Q15797 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
SMAD1Q15797 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
SMAD1Q15797 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SMAD1Q15797 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
SMAD1Q15797 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SMAD1Q15797 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SMAD1Q15797 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SMAD1Q15797 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SMAD1Q15797 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SMAD1Q15797 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.3 ms