Protein–RNA interactions for Protein: Q15397

PUM3, Pumilio homolog 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 648 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUM3Q15397 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
PUM3Q15397 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
PUM3Q15397 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
PUM3Q15397 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
PUM3Q15397 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
PUM3Q15397 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
PUM3Q15397 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
PUM3Q15397 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
PUM3Q15397 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
PUM3Q15397 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
PUM3Q15397 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
PUM3Q15397 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.01■■■□□ 2.23
PUM3Q15397 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
PUM3Q15397 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
PUM3Q15397 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
PUM3Q15397 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
PUM3Q15397 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
PUM3Q15397 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC29■■■□□ 2.23
PUM3Q15397 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
PUM3Q15397 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC29■■■□□ 2.23
PUM3Q15397 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
PUM3Q15397 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
PUM3Q15397 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
PUM3Q15397 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
PUM3Q15397 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
PUM3Q15397 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
PUM3Q15397 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
PUM3Q15397 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
PUM3Q15397 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
PUM3Q15397 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
PUM3Q15397 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
PUM3Q15397 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
PUM3Q15397 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
PUM3Q15397 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
PUM3Q15397 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
PUM3Q15397 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
PUM3Q15397 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
PUM3Q15397 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
PUM3Q15397 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
PUM3Q15397 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
PUM3Q15397 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
PUM3Q15397 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
PUM3Q15397 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
PUM3Q15397 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
PUM3Q15397 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
PUM3Q15397 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
PUM3Q15397 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
PUM3Q15397 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
PUM3Q15397 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
PUM3Q15397 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
PUM3Q15397 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
PUM3Q15397 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.23
PUM3Q15397 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
PUM3Q15397 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC28.95■■■□□ 2.22
PUM3Q15397 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC28.95■■■□□ 2.22
PUM3Q15397 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
PUM3Q15397 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
PUM3Q15397 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
PUM3Q15397 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
PUM3Q15397 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
PUM3Q15397 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
PUM3Q15397 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
PUM3Q15397 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
PUM3Q15397 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
PUM3Q15397 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
PUM3Q15397 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
PUM3Q15397 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
PUM3Q15397 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
PUM3Q15397 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
PUM3Q15397 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC28.92■■■□□ 2.22
PUM3Q15397 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
PUM3Q15397 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
PUM3Q15397 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
PUM3Q15397 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
PUM3Q15397 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
PUM3Q15397 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
PUM3Q15397 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
PUM3Q15397 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
PUM3Q15397 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC28.9■■■□□ 2.22
PUM3Q15397 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
PUM3Q15397 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
PUM3Q15397 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC28.9■■■□□ 2.22
PUM3Q15397 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
PUM3Q15397 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
PUM3Q15397 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
PUM3Q15397 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC28.89■■■□□ 2.22
PUM3Q15397 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
PUM3Q15397 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
PUM3Q15397 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
PUM3Q15397 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
PUM3Q15397 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
PUM3Q15397 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
PUM3Q15397 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
PUM3Q15397 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
PUM3Q15397 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
PUM3Q15397 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
PUM3Q15397 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
PUM3Q15397 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC28.88■■■□□ 2.21
PUM3Q15397 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
PUM3Q15397 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
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