Protein–RNA interactions for Protein: Q15306

IRF4, Interferon regulatory factor 4, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF4Q15306 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
IRF4Q15306 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
IRF4Q15306 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
IRF4Q15306 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
IRF4Q15306 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
IRF4Q15306 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
IRF4Q15306 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
IRF4Q15306 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
IRF4Q15306 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
IRF4Q15306 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
IRF4Q15306 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
IRF4Q15306 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
IRF4Q15306 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
IRF4Q15306 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
IRF4Q15306 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC23.45■■□□□ 1.34
IRF4Q15306 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
IRF4Q15306 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
IRF4Q15306 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
IRF4Q15306 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
IRF4Q15306 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
IRF4Q15306 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
IRF4Q15306 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
IRF4Q15306 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
IRF4Q15306 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
IRF4Q15306 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
IRF4Q15306 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
IRF4Q15306 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
IRF4Q15306 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
IRF4Q15306 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
IRF4Q15306 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
IRF4Q15306 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
IRF4Q15306 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
IRF4Q15306 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
IRF4Q15306 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
IRF4Q15306 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
IRF4Q15306 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
IRF4Q15306 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
IRF4Q15306 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
IRF4Q15306 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
IRF4Q15306 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
IRF4Q15306 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
IRF4Q15306 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
IRF4Q15306 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
IRF4Q15306 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
IRF4Q15306 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
IRF4Q15306 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
IRF4Q15306 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
IRF4Q15306 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
IRF4Q15306 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
IRF4Q15306 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
IRF4Q15306 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
IRF4Q15306 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
IRF4Q15306 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
IRF4Q15306 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
IRF4Q15306 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
IRF4Q15306 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
IRF4Q15306 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
IRF4Q15306 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
IRF4Q15306 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
IRF4Q15306 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
IRF4Q15306 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
IRF4Q15306 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
IRF4Q15306 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
IRF4Q15306 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
IRF4Q15306 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
IRF4Q15306 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
IRF4Q15306 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
IRF4Q15306 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
IRF4Q15306 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC23.37■■□□□ 1.33
IRF4Q15306 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
IRF4Q15306 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
IRF4Q15306 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC23.37■■□□□ 1.33
IRF4Q15306 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
IRF4Q15306 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
IRF4Q15306 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
IRF4Q15306 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
IRF4Q15306 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
IRF4Q15306 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
IRF4Q15306 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
IRF4Q15306 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
IRF4Q15306 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
IRF4Q15306 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
IRF4Q15306 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
IRF4Q15306 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
IRF4Q15306 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
IRF4Q15306 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
IRF4Q15306 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
IRF4Q15306 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
IRF4Q15306 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
IRF4Q15306 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
IRF4Q15306 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
IRF4Q15306 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
IRF4Q15306 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
IRF4Q15306 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC23.34■■□□□ 1.33
IRF4Q15306 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
IRF4Q15306 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
IRF4Q15306 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
IRF4Q15306 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
IRF4Q15306 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
IRF4Q15306 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
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