Protein–RNA interactions for Protein: Q147U7

SMCO1, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMCO1Q147U7 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
SMCO1Q147U7 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
SMCO1Q147U7 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC19.63■□□□□ 0.73
SMCO1Q147U7 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
SMCO1Q147U7 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
SMCO1Q147U7 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
SMCO1Q147U7 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
SMCO1Q147U7 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SMCO1Q147U7 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SMCO1Q147U7 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SMCO1Q147U7 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SMCO1Q147U7 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
SMCO1Q147U7 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC19.62■□□□□ 0.73
SMCO1Q147U7 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SMCO1Q147U7 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SMCO1Q147U7 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
SMCO1Q147U7 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
SMCO1Q147U7 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
SMCO1Q147U7 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SMCO1Q147U7 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SMCO1Q147U7 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SMCO1Q147U7 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
SMCO1Q147U7 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SMCO1Q147U7 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SMCO1Q147U7 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SMCO1Q147U7 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SMCO1Q147U7 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SMCO1Q147U7 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SMCO1Q147U7 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SMCO1Q147U7 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SMCO1Q147U7 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SMCO1Q147U7 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SMCO1Q147U7 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SMCO1Q147U7 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SMCO1Q147U7 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SMCO1Q147U7 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SMCO1Q147U7 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SMCO1Q147U7 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SMCO1Q147U7 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
SMCO1Q147U7 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SMCO1Q147U7 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SMCO1Q147U7 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SMCO1Q147U7 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SMCO1Q147U7 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SMCO1Q147U7 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
SMCO1Q147U7 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SMCO1Q147U7 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
SMCO1Q147U7 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
SMCO1Q147U7 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
SMCO1Q147U7 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
SMCO1Q147U7 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
SMCO1Q147U7 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
SMCO1Q147U7 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
SMCO1Q147U7 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SMCO1Q147U7 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SMCO1Q147U7 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SMCO1Q147U7 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SMCO1Q147U7 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SMCO1Q147U7 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SMCO1Q147U7 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SMCO1Q147U7 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SMCO1Q147U7 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SMCO1Q147U7 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SMCO1Q147U7 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SMCO1Q147U7 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SMCO1Q147U7 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SMCO1Q147U7 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SMCO1Q147U7 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SMCO1Q147U7 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SMCO1Q147U7 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SMCO1Q147U7 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SMCO1Q147U7 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SMCO1Q147U7 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SMCO1Q147U7 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SMCO1Q147U7 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SMCO1Q147U7 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SMCO1Q147U7 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SMCO1Q147U7 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SMCO1Q147U7 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SMCO1Q147U7 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SMCO1Q147U7 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SMCO1Q147U7 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SMCO1Q147U7 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SMCO1Q147U7 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SMCO1Q147U7 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SMCO1Q147U7 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SMCO1Q147U7 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SMCO1Q147U7 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SMCO1Q147U7 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SMCO1Q147U7 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SMCO1Q147U7 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SMCO1Q147U7 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SMCO1Q147U7 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SMCO1Q147U7 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SMCO1Q147U7 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
SMCO1Q147U7 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SMCO1Q147U7 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
SMCO1Q147U7 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SMCO1Q147U7 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SMCO1Q147U7 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
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