Protein–RNA interactions for Protein: Q13564

NAE1, NEDD8-activating enzyme E1 regulatory subunit, humanhuman

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Length 534 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NAE1Q13564 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NAE1Q13564 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NAE1Q13564 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NAE1Q13564 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
NAE1Q13564 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NAE1Q13564 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NAE1Q13564 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NAE1Q13564 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NAE1Q13564 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NAE1Q13564 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NAE1Q13564 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NAE1Q13564 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NAE1Q13564 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NAE1Q13564 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NAE1Q13564 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NAE1Q13564 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NAE1Q13564 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NAE1Q13564 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NAE1Q13564 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NAE1Q13564 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NAE1Q13564 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NAE1Q13564 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NAE1Q13564 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NAE1Q13564 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
NAE1Q13564 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NAE1Q13564 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NAE1Q13564 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NAE1Q13564 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NAE1Q13564 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NAE1Q13564 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NAE1Q13564 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NAE1Q13564 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NAE1Q13564 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NAE1Q13564 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NAE1Q13564 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
NAE1Q13564 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
NAE1Q13564 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NAE1Q13564 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
NAE1Q13564 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NAE1Q13564 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NAE1Q13564 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NAE1Q13564 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
NAE1Q13564 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NAE1Q13564 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NAE1Q13564 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NAE1Q13564 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NAE1Q13564 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
NAE1Q13564 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NAE1Q13564 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NAE1Q13564 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NAE1Q13564 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NAE1Q13564 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NAE1Q13564 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NAE1Q13564 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NAE1Q13564 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NAE1Q13564 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NAE1Q13564 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NAE1Q13564 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NAE1Q13564 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NAE1Q13564 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NAE1Q13564 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NAE1Q13564 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NAE1Q13564 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NAE1Q13564 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NAE1Q13564 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NAE1Q13564 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NAE1Q13564 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NAE1Q13564 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NAE1Q13564 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
NAE1Q13564 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NAE1Q13564 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
NAE1Q13564 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NAE1Q13564 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NAE1Q13564 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NAE1Q13564 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NAE1Q13564 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NAE1Q13564 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
NAE1Q13564 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NAE1Q13564 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NAE1Q13564 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NAE1Q13564 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NAE1Q13564 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NAE1Q13564 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NAE1Q13564 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NAE1Q13564 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NAE1Q13564 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NAE1Q13564 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NAE1Q13564 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NAE1Q13564 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NAE1Q13564 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NAE1Q13564 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NAE1Q13564 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NAE1Q13564 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NAE1Q13564 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NAE1Q13564 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NAE1Q13564 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NAE1Q13564 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NAE1Q13564 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NAE1Q13564 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NAE1Q13564 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
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