Protein–RNA interactions for Protein: Q12923

PTPN13, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 13, humanhuman

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Length 2,485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN13Q12923 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
PTPN13Q12923 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PTPN13Q12923 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PTPN13Q12923 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PTPN13Q12923 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PTPN13Q12923 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PTPN13Q12923 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PTPN13Q12923 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
PTPN13Q12923 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PTPN13Q12923 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PTPN13Q12923 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
PTPN13Q12923 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PTPN13Q12923 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PTPN13Q12923 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PTPN13Q12923 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PTPN13Q12923 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PTPN13Q12923 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PTPN13Q12923 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PTPN13Q12923 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PTPN13Q12923 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PTPN13Q12923 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PTPN13Q12923 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PTPN13Q12923 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PTPN13Q12923 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
PTPN13Q12923 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PTPN13Q12923 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PTPN13Q12923 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PTPN13Q12923 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PTPN13Q12923 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PTPN13Q12923 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PTPN13Q12923 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
PTPN13Q12923 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PTPN13Q12923 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PTPN13Q12923 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PTPN13Q12923 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
PTPN13Q12923 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
PTPN13Q12923 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
PTPN13Q12923 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
PTPN13Q12923 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
PTPN13Q12923 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
PTPN13Q12923 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
PTPN13Q12923 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
PTPN13Q12923 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
PTPN13Q12923 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
PTPN13Q12923 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
PTPN13Q12923 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
PTPN13Q12923 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
PTPN13Q12923 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
PTPN13Q12923 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
PTPN13Q12923 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PTPN13Q12923 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PTPN13Q12923 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PTPN13Q12923 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PTPN13Q12923 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
PTPN13Q12923 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PTPN13Q12923 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PTPN13Q12923 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PTPN13Q12923 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PTPN13Q12923 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PTPN13Q12923 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PTPN13Q12923 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PTPN13Q12923 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PTPN13Q12923 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PTPN13Q12923 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PTPN13Q12923 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PTPN13Q12923 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PTPN13Q12923 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PTPN13Q12923 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PTPN13Q12923 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PTPN13Q12923 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PTPN13Q12923 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PTPN13Q12923 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PTPN13Q12923 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PTPN13Q12923 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PTPN13Q12923 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PTPN13Q12923 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PTPN13Q12923 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PTPN13Q12923 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PTPN13Q12923 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PTPN13Q12923 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PTPN13Q12923 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PTPN13Q12923 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PTPN13Q12923 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PTPN13Q12923 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PTPN13Q12923 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
PTPN13Q12923 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PTPN13Q12923 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PTPN13Q12923 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PTPN13Q12923 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
PTPN13Q12923 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
PTPN13Q12923 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
PTPN13Q12923 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.91
PTPN13Q12923 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.91
PTPN13Q12923 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PTPN13Q12923 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC20.76■□□□□ 0.91
PTPN13Q12923 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PTPN13Q12923 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
PTPN13Q12923 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
PTPN13Q12923 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PTPN13Q12923 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
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