Protein–RNA interactions for Protein: Q12460

NOP56, Nucleolar protein 56, yeastyeast

Known RBP RIP-Chip data

Length 504 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
NOP56Q12460 DXO1YDR370C 1329 nt5.99□□□□□ -1.45
NOP56Q12460 UTR2YEL040W 1404 nt5.99□□□□□ -1.45 RIP-Chip
NOP56Q12460 GIP2YER054C 1647 nt5.99□□□□□ -1.45
NOP56Q12460 MID1YNL291C 1647 nt5.99□□□□□ -1.45
NOP56Q12460 UBA2YDR390C 1911 nt5.99□□□□□ -1.45
NOP56Q12460 IMA1YGR287C 1770 nt5.99□□□□□ -1.45
NOP56Q12460 DFG5YMR238W 1377 nt5.99□□□□□ -1.45
NOP56Q12460 PDA1YER178W 1263 nt5.99□□□□□ -1.45
NOP56Q12460 DMA1YHR115C 1251 nt5.99□□□□□ -1.45
NOP56Q12460 YJR085CYJR085C 318 nt5.99□□□□□ -1.45
NOP56Q12460 RPR1RPR1 369 nt5.99□□□□□ -1.45
NOP56Q12460 YOL050CYOL050C 321 nt5.99□□□□□ -1.45
NOP56Q12460 PAF1YBR279W 1338 nt5.99□□□□□ -1.45
NOP56Q12460 VTC2YFL004W 2487 nt5.98□□□□□ -1.45
NOP56Q12460 YDL177CYDL177C 513 nt5.98□□□□□ -1.45
NOP56Q12460 YSC83YHR017W 1158 nt5.98□□□□□ -1.45
NOP56Q12460 XPT1YJR133W 630 nt5.98□□□□□ -1.45
NOP56Q12460 NPT1YOR209C 1290 nt5.98□□□□□ -1.45
NOP56Q12460 CTF19YPL018W 1110 nt5.98□□□□□ -1.45 RIP-Chip
NOP56Q12460 ERG10YPL028W 1197 nt5.98□□□□□ -1.45
NOP56Q12460 PPR1YLR014C 2715 nt5.98□□□□□ -1.45
NOP56Q12460 MCM21YDR318W 1107 nt5.97□□□□□ -1.45
NOP56Q12460 MRPS28YDR337W 861 nt5.97□□□□□ -1.45
NOP56Q12460 AIM46YHR199C 933 nt5.97□□□□□ -1.45
NOP56Q12460 CYS3YAL012W 1185 nt5.97□□□□□ -1.45
NOP56Q12460 YKL169CYKL169C 384 nt5.97□□□□□ -1.45
NOP56Q12460 MRPL19YNL185C 477 nt5.97□□□□□ -1.45
NOP56Q12460 FIT2YOR382W 462 nt5.97□□□□□ -1.45
NOP56Q12460 PET20YPL159C 762 nt5.97□□□□□ -1.45
NOP56Q12460 YBR113WYBR113W 483 nt5.97□□□□□ -1.45
NOP56Q12460 HXT5YHR096C 1779 nt5.96□□□□□ -1.46
NOP56Q12460 CTS2YDR371W 1536 nt5.96□□□□□ -1.46
NOP56Q12460 YJL163CYJL163C 1668 nt5.96□□□□□ -1.46
NOP56Q12460 YGL102CYGL102C 429 nt5.96□□□□□ -1.46
NOP56Q12460 TIF34YMR146C 1044 nt5.96□□□□□ -1.46
NOP56Q12460 POR1YNL055C 852 nt5.96□□□□□ -1.46
NOP56Q12460 NOP13YNL175C 1212 nt5.96□□□□□ -1.46
NOP56Q12460 MDY2YOL111C 639 nt5.96□□□□□ -1.46
NOP56Q12460 QRI1YDL103C 1434 nt5.96□□□□□ -1.46
NOP56Q12460 SOG2YOR353C 2376 nt5.96□□□□□ -1.46
NOP56Q12460 ELP2YGR200C 2367 nt5.95□□□□□ -1.46
NOP56Q12460 YGR011WYGR011W 327 nt5.95□□□□□ -1.46
NOP56Q12460 YIL086CYIL086C 309 nt5.95□□□□□ -1.46
NOP56Q12460 PRI1YIR008C 1230 nt5.95□□□□□ -1.46
NOP56Q12460 SPC34YKR037C 888 nt5.95□□□□□ -1.46
NOP56Q12460 PSR1YLL010C 1284 nt5.95□□□□□ -1.46
NOP56Q12460 YLL056CYLL056C 897 nt5.95□□□□□ -1.46
NOP56Q12460 RPL31BYLR406C 342 nt5.95□□□□□ -1.46
NOP56Q12460 SML1YML058W 315 nt5.95□□□□□ -1.46
NOP56Q12460 TMA46YOR091W 1038 nt5.95□□□□□ -1.46
NOP56Q12460 SMX3YPR182W 261 nt5.95□□□□□ -1.46
NOP56Q12460 PEX32YBR168W 1242 nt5.95□□□□□ -1.46
NOP56Q12460 TRP3YKL211C 1455 nt5.95□□□□□ -1.46
NOP56Q12460 MFG1YDL233W 1377 nt5.94□□□□□ -1.46
NOP56Q12460 NUP1YOR098C 3231 nt5.94□□□□□ -1.46 RIP-Chip
NOP56Q12460 MRE11YMR224C 2079 nt5.94□□□□□ -1.46
NOP56Q12460 ORC5YNL261W 1440 nt5.94□□□□□ -1.46
NOP56Q12460 SNM1YDR478W 597 nt5.94□□□□□ -1.46
NOP56Q12460 ERV14YGL054C 417 nt5.94□□□□□ -1.46
NOP56Q12460 SPO74YGL170C 1242 nt5.94□□□□□ -1.46
NOP56Q12460 CTR2YHR175W 570 nt5.94□□□□□ -1.46
NOP56Q12460 MRS1YIR021W 1092 nt5.94□□□□□ -1.46
NOP56Q12460 YJL215CYJL215C 360 nt5.94□□□□□ -1.46
NOP56Q12460 NHP6BYBR089C-A 300 nt5.94□□□□□ -1.46
NOP56Q12460 VPS36YLR417W 1701 nt5.94□□□□□ -1.46
NOP56Q12460 VPS61YDR136C 573 nt5.93□□□□□ -1.46
NOP56Q12460 SNZ3YFL059W 897 nt5.93□□□□□ -1.46
NOP56Q12460 RPP1YHR062C 882 nt5.93□□□□□ -1.46
NOP56Q12460 OMA1YKR087C 1038 nt5.93□□□□□ -1.46
NOP56Q12460 MAC1YMR021C 1254 nt5.93□□□□□ -1.46
NOP56Q12460 YOL024WYOL024W 519 nt5.93□□□□□ -1.46
NOP56Q12460 YPR076WYPR076W 375 nt5.93□□□□□ -1.46
NOP56Q12460 YPR123CYPR123C 435 nt5.93□□□□□ -1.46
NOP56Q12460 LCB2YDR062W 1686 nt5.93□□□□□ -1.46 RIP-Chip
NOP56Q12460 ARO9YHR137W 1542 nt5.93□□□□□ -1.46
NOP56Q12460 PRP24YMR268C 1335 nt5.93□□□□□ -1.46
NOP56Q12460 HXT3YDR345C 1704 nt5.92□□□□□ -1.46
NOP56Q12460 tG(GCC)BtG(GCC)B 71 nt5.92□□□□□ -1.46
NOP56Q12460 SUF16tG(GCC)C 71 nt5.92□□□□□ -1.46
NOP56Q12460 tG(GCC)D1tG(GCC)D1 71 nt5.92□□□□□ -1.46
NOP56Q12460 tG(GCC)D2tG(GCC)D2 71 nt5.92□□□□□ -1.46
NOP56Q12460 tG(GCC)EtG(GCC)E 71 nt5.92□□□□□ -1.46
NOP56Q12460 SUF20tG(GCC)F1 71 nt5.92□□□□□ -1.46
NOP56Q12460 tG(GCC)F2tG(GCC)F2 71 nt5.92□□□□□ -1.46
NOP56Q12460 tG(GCC)G1tG(GCC)G1 71 nt5.92□□□□□ -1.46
NOP56Q12460 tG(GCC)G2tG(GCC)G2 71 nt5.92□□□□□ -1.46
NOP56Q12460 tG(GCC)J1tG(GCC)J1 71 nt5.92□□□□□ -1.46
NOP56Q12460 SUF23tG(GCC)J2 71 nt5.92□□□□□ -1.46
NOP56Q12460 tG(GCC)MtG(GCC)M 71 nt5.92□□□□□ -1.46
NOP56Q12460 tG(GCC)O1tG(GCC)O1 71 nt5.92□□□□□ -1.46
NOP56Q12460 SUF17tG(GCC)O2 71 nt5.92□□□□□ -1.46
NOP56Q12460 tG(GCC)P1tG(GCC)P1 71 nt5.92□□□□□ -1.46
NOP56Q12460 tG(GCC)P2tG(GCC)P2 71 nt5.92□□□□□ -1.46
NOP56Q12460 UBC6YER100W 753 nt5.92□□□□□ -1.46
NOP56Q12460 CBR1YIL043C 855 nt5.92□□□□□ -1.46
NOP56Q12460 YLR412C-AYLR412C-A 207 nt5.92□□□□□ -1.46
NOP56Q12460 ADD37YMR184W 597 nt5.92□□□□□ -1.46
NOP56Q12460 ERI1YPL096C-A 207 nt5.92□□□□□ -1.46
NOP56Q12460 MAD3YJL013C 1548 nt5.92□□□□□ -1.46
NOP56Q12460 HOS1YPR068C 1413 nt5.91□□□□□ -1.46
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