Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF96

CGNL1, Cingulin-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,302 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CGNL1Q0VF96 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC32.29■■■□□ 2.76
CGNL1Q0VF96 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
CGNL1Q0VF96 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
CGNL1Q0VF96 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
CGNL1Q0VF96 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC32.29■■■□□ 2.76
CGNL1Q0VF96 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC32.29■■■□□ 2.76
CGNL1Q0VF96 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC32.29■■■□□ 2.76
CGNL1Q0VF96 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
CGNL1Q0VF96 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC32.28■■■□□ 2.76
CGNL1Q0VF96 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC32.28■■■□□ 2.76
CGNL1Q0VF96 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
CGNL1Q0VF96 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
CGNL1Q0VF96 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
CGNL1Q0VF96 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.27■■■□□ 2.76
CGNL1Q0VF96 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC32.27■■■□□ 2.76
CGNL1Q0VF96 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
CGNL1Q0VF96 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.27■■■□□ 2.76
CGNL1Q0VF96 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
CGNL1Q0VF96 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.26■■■□□ 2.76
CGNL1Q0VF96 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC32.26■■■□□ 2.75
CGNL1Q0VF96 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC32.26■■■□□ 2.75
CGNL1Q0VF96 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC32.26■■■□□ 2.75
CGNL1Q0VF96 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
CGNL1Q0VF96 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.26■■■□□ 2.75
CGNL1Q0VF96 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC32.26■■■□□ 2.75
CGNL1Q0VF96 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC32.26■■■□□ 2.75
CGNL1Q0VF96 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
CGNL1Q0VF96 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
CGNL1Q0VF96 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
CGNL1Q0VF96 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
CGNL1Q0VF96 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.25■■■□□ 2.75
CGNL1Q0VF96 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC32.25■■■□□ 2.75
CGNL1Q0VF96 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC32.25■■■□□ 2.75
CGNL1Q0VF96 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.25■■■□□ 2.75
CGNL1Q0VF96 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
CGNL1Q0VF96 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC32.24■■■□□ 2.75
CGNL1Q0VF96 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
CGNL1Q0VF96 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
CGNL1Q0VF96 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC32.24■■■□□ 2.75
CGNL1Q0VF96 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC32.23■■■□□ 2.75
CGNL1Q0VF96 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC32.23■■■□□ 2.75
CGNL1Q0VF96 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC32.23■■■□□ 2.75
CGNL1Q0VF96 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
CGNL1Q0VF96 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC32.22■■■□□ 2.75
CGNL1Q0VF96 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC32.22■■■□□ 2.75
CGNL1Q0VF96 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
CGNL1Q0VF96 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
CGNL1Q0VF96 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC32.21■■■□□ 2.75
CGNL1Q0VF96 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC32.21■■■□□ 2.75
CGNL1Q0VF96 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC32.21■■■□□ 2.75
CGNL1Q0VF96 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC32.21■■■□□ 2.75
CGNL1Q0VF96 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC32.21■■■□□ 2.75
CGNL1Q0VF96 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
CGNL1Q0VF96 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC32.2■■■□□ 2.75
CGNL1Q0VF96 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.74
CGNL1Q0VF96 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.74
CGNL1Q0VF96 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC32.2■■■□□ 2.74
CGNL1Q0VF96 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.19■■■□□ 2.74
CGNL1Q0VF96 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
CGNL1Q0VF96 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
CGNL1Q0VF96 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC32.19■■■□□ 2.74
CGNL1Q0VF96 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
CGNL1Q0VF96 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.19■■■□□ 2.74
CGNL1Q0VF96 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC32.19■■■□□ 2.74
CGNL1Q0VF96 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC32.19■■■□□ 2.74
CGNL1Q0VF96 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
CGNL1Q0VF96 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC32.18■■■□□ 2.74
CGNL1Q0VF96 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
CGNL1Q0VF96 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC32.18■■■□□ 2.74
CGNL1Q0VF96 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
CGNL1Q0VF96 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC32.18■■■□□ 2.74
CGNL1Q0VF96 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC32.18■■■□□ 2.74
CGNL1Q0VF96 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC32.17■■■□□ 2.74
CGNL1Q0VF96 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
CGNL1Q0VF96 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC32.17■■■□□ 2.74
CGNL1Q0VF96 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.17■■■□□ 2.74
CGNL1Q0VF96 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
CGNL1Q0VF96 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
CGNL1Q0VF96 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
CGNL1Q0VF96 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.16■■■□□ 2.74
CGNL1Q0VF96 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.16■■■□□ 2.74
CGNL1Q0VF96 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
CGNL1Q0VF96 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC32.16■■■□□ 2.74
CGNL1Q0VF96 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
CGNL1Q0VF96 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC32.15■■■□□ 2.74
CGNL1Q0VF96 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.15■■■□□ 2.74
CGNL1Q0VF96 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC32.15■■■□□ 2.74
CGNL1Q0VF96 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
CGNL1Q0VF96 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
CGNL1Q0VF96 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.15■■■□□ 2.74
CGNL1Q0VF96 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
CGNL1Q0VF96 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC32.14■■■□□ 2.74
CGNL1Q0VF96 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.14■■■□□ 2.74
CGNL1Q0VF96 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
CGNL1Q0VF96 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
CGNL1Q0VF96 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
CGNL1Q0VF96 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC32.13■■■□□ 2.73
CGNL1Q0VF96 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC32.13■■■□□ 2.73
CGNL1Q0VF96 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
CGNL1Q0VF96 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC32.12■■■□□ 2.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms