Protein–RNA interactions for Protein: Q08722

CD47, Leukocyte surface antigen CD47, humanhuman

Predictions only

Length 323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD47Q08722 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CD47Q08722 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CD47Q08722 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CD47Q08722 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CD47Q08722 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CD47Q08722 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CD47Q08722 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CD47Q08722 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CD47Q08722 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
CD47Q08722 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CD47Q08722 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CD47Q08722 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CD47Q08722 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CD47Q08722 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CD47Q08722 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CD47Q08722 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CD47Q08722 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CD47Q08722 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CD47Q08722 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CD47Q08722 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CD47Q08722 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CD47Q08722 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CD47Q08722 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CD47Q08722 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CD47Q08722 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CD47Q08722 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CD47Q08722 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CD47Q08722 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CD47Q08722 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CD47Q08722 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CD47Q08722 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CD47Q08722 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CD47Q08722 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CD47Q08722 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CD47Q08722 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CD47Q08722 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CD47Q08722 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CD47Q08722 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
CD47Q08722 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CD47Q08722 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CD47Q08722 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CD47Q08722 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CD47Q08722 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CD47Q08722 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CD47Q08722 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CD47Q08722 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CD47Q08722 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CD47Q08722 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
CD47Q08722 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CD47Q08722 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
CD47Q08722 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
CD47Q08722 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
CD47Q08722 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CD47Q08722 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CD47Q08722 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CD47Q08722 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CD47Q08722 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CD47Q08722 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CD47Q08722 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CD47Q08722 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CD47Q08722 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CD47Q08722 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CD47Q08722 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CD47Q08722 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CD47Q08722 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CD47Q08722 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CD47Q08722 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CD47Q08722 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CD47Q08722 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CD47Q08722 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CD47Q08722 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CD47Q08722 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CD47Q08722 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CD47Q08722 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CD47Q08722 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CD47Q08722 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CD47Q08722 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CD47Q08722 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CD47Q08722 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CD47Q08722 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
CD47Q08722 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CD47Q08722 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CD47Q08722 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CD47Q08722 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
CD47Q08722 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CD47Q08722 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CD47Q08722 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CD47Q08722 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CD47Q08722 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CD47Q08722 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CD47Q08722 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CD47Q08722 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CD47Q08722 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CD47Q08722 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CD47Q08722 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CD47Q08722 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CD47Q08722 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CD47Q08722 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CD47Q08722 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CD47Q08722 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.9 ms