Protein–RNA interactions for Protein: Q06547

GABPB1, GA-binding protein subunit beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABPB1Q06547 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GABPB1Q06547 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GABPB1Q06547 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GABPB1Q06547 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
GABPB1Q06547 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
GABPB1Q06547 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
GABPB1Q06547 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
GABPB1Q06547 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
GABPB1Q06547 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
GABPB1Q06547 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
GABPB1Q06547 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
GABPB1Q06547 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
GABPB1Q06547 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
GABPB1Q06547 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
GABPB1Q06547 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
GABPB1Q06547 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
GABPB1Q06547 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
GABPB1Q06547 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
GABPB1Q06547 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
GABPB1Q06547 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GABPB1Q06547 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
GABPB1Q06547 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GABPB1Q06547 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GABPB1Q06547 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
GABPB1Q06547 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
GABPB1Q06547 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
GABPB1Q06547 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
GABPB1Q06547 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
GABPB1Q06547 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GABPB1Q06547 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
GABPB1Q06547 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GABPB1Q06547 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GABPB1Q06547 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GABPB1Q06547 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GABPB1Q06547 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
GABPB1Q06547 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
GABPB1Q06547 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
GABPB1Q06547 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GABPB1Q06547 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
GABPB1Q06547 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GABPB1Q06547 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GABPB1Q06547 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
GABPB1Q06547 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GABPB1Q06547 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GABPB1Q06547 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GABPB1Q06547 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
GABPB1Q06547 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GABPB1Q06547 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
GABPB1Q06547 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GABPB1Q06547 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GABPB1Q06547 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GABPB1Q06547 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
GABPB1Q06547 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GABPB1Q06547 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
GABPB1Q06547 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GABPB1Q06547 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GABPB1Q06547 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GABPB1Q06547 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
GABPB1Q06547 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GABPB1Q06547 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GABPB1Q06547 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GABPB1Q06547 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GABPB1Q06547 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GABPB1Q06547 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
GABPB1Q06547 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GABPB1Q06547 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GABPB1Q06547 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
GABPB1Q06547 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GABPB1Q06547 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
GABPB1Q06547 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GABPB1Q06547 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
GABPB1Q06547 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
GABPB1Q06547 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
GABPB1Q06547 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
GABPB1Q06547 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GABPB1Q06547 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
GABPB1Q06547 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GABPB1Q06547 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
GABPB1Q06547 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GABPB1Q06547 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GABPB1Q06547 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
GABPB1Q06547 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
GABPB1Q06547 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GABPB1Q06547 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
GABPB1Q06547 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GABPB1Q06547 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
GABPB1Q06547 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
GABPB1Q06547 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GABPB1Q06547 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
GABPB1Q06547 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GABPB1Q06547 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GABPB1Q06547 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GABPB1Q06547 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
GABPB1Q06547 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GABPB1Q06547 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
GABPB1Q06547 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GABPB1Q06547 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
GABPB1Q06547 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
GABPB1Q06547 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
GABPB1Q06547 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.3 ms