Protein–RNA interactions for Protein: Q06159

ATG39, Autophagy-related protein 39, yeastyeast

Predictions only

Length 398 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
ATG39Q06159 ASH1YKL185W 1767 nt4.7□□□□□ -1.66
ATG39Q06159 RPE1YJL121C 717 nt4.7□□□□□ -1.66
ATG39Q06159 TSA1YML028W 591 nt4.7□□□□□ -1.66
ATG39Q06159 YNL285WYNL285W 372 nt4.7□□□□□ -1.66
ATG39Q06159 SNZ2YNL333W 897 nt4.7□□□□□ -1.66
ATG39Q06159 COX11YPL132W 903 nt4.7□□□□□ -1.66
ATG39Q06159 GUD1YDL238C 1470 nt4.69□□□□□ -1.66
ATG39Q06159 ATP1YBL099W 1638 nt4.69□□□□□ -1.66
ATG39Q06159 CDC34YDR054C 888 nt4.69□□□□□ -1.66
ATG39Q06159 RPT3YDR394W 1287 nt4.69□□□□□ -1.66
ATG39Q06159 YEL068CYEL068C 333 nt4.69□□□□□ -1.66
ATG39Q06159 MRPS16YPL013C 366 nt4.69□□□□□ -1.66
ATG39Q06159 ICL1YER065C 1674 nt4.69□□□□□ -1.66
ATG39Q06159 HST3YOR025W 1344 nt4.69□□□□□ -1.66
ATG39Q06159 SIT1YEL065W 1887 nt4.69□□□□□ -1.66
ATG39Q06159 ARN2YHL047C 1863 nt4.69□□□□□ -1.66
ATG39Q06159 SIA1YOR137C 1869 nt4.69□□□□□ -1.66
ATG39Q06159 SIT4YDL047W 936 nt4.68□□□□□ -1.66
ATG39Q06159 YLR157W-EYLR157W-E 165 nt4.68□□□□□ -1.66
ATG39Q06159 YNL097W-AYNL097W-A 156 nt4.68□□□□□ -1.66
ATG39Q06159 PPG1YNR032W 1107 nt4.68□□□□□ -1.66
ATG39Q06159 WTM2YOR229W 1404 nt4.68□□□□□ -1.66
ATG39Q06159 GUA1YMR217W 1578 nt4.68□□□□□ -1.66
ATG39Q06159 MET7YOR241W 1647 nt4.68□□□□□ -1.66
ATG39Q06159 YDR034W-BYDR034W-B 156 nt4.67□□□□□ -1.66
ATG39Q06159 NCS6YGL211W 1080 nt4.67□□□□□ -1.66
ATG39Q06159 QRI5YLR204W 336 nt4.67□□□□□ -1.66
ATG39Q06159 YHM2YMR241W 945 nt4.67□□□□□ -1.66
ATG39Q06159 YTH1YPR107C 627 nt4.67□□□□□ -1.66
ATG39Q06159 YPR114WYPR114W 948 nt4.67□□□□□ -1.66
ATG39Q06159 DRS1YLL008W 2259 nt4.67□□□□□ -1.66
ATG39Q06159 PSE1YMR308C 3270 nt4.66□□□□□ -1.66
ATG39Q06159 MDM31YHR194W 1740 nt4.66□□□□□ -1.66
ATG39Q06159 YEL077CYEL077C 3834 nt4.66□□□□□ -1.66
ATG39Q06159 SUP2tY(GUA)D 75 nt4.66□□□□□ -1.66
ATG39Q06159 SUP11tY(GUA)F1 75 nt4.66□□□□□ -1.66
ATG39Q06159 SUP6tY(GUA)F2 75 nt4.66□□□□□ -1.66
ATG39Q06159 SUP7tY(GUA)J1 75 nt4.66□□□□□ -1.66
ATG39Q06159 SUP4tY(GUA)J2 75 nt4.66□□□□□ -1.66
ATG39Q06159 SUP5tY(GUA)M1 75 nt4.66□□□□□ -1.66
ATG39Q06159 SUP8tY(GUA)M2 75 nt4.66□□□□□ -1.66
ATG39Q06159 SUP3tY(GUA)O 75 nt4.66□□□□□ -1.66
ATG39Q06159 TIF2YJL138C 1188 nt4.66□□□□□ -1.66
ATG39Q06159 RPS5YJR123W 678 nt4.66□□□□□ -1.66
ATG39Q06159 TIF1YKR059W 1188 nt4.66□□□□□ -1.66
ATG39Q06159 JNM1YMR294W 1122 nt4.66□□□□□ -1.66
ATG39Q06159 RPN7YPR108W 1290 nt4.66□□□□□ -1.66
ATG39Q06159 KKQ8YKL168C 2175 nt4.65□□□□□ -1.66
ATG39Q06159 ADE13YLR359W 1449 nt4.65□□□□□ -1.66
ATG39Q06159 SSK22YCR073C 3996 nt4.65□□□□□ -1.66
ATG39Q06159 PDC1YLR044C 1692 nt4.65□□□□□ -1.66
ATG39Q06159 tR(ACG)DtR(ACG)D 73 nt4.65□□□□□ -1.67
ATG39Q06159 tR(ACG)EtR(ACG)E 73 nt4.65□□□□□ -1.67
ATG39Q06159 tR(ACG)KtR(ACG)K 73 nt4.65□□□□□ -1.67
ATG39Q06159 tR(ACG)LtR(ACG)L 73 nt4.65□□□□□ -1.67
ATG39Q06159 tR(ACG)OtR(ACG)O 73 nt4.65□□□□□ -1.67
ATG39Q06159 DOT5YIL010W 648 nt4.65□□□□□ -1.67
ATG39Q06159 RPL10YLR075W 666 nt4.65□□□□□ -1.67
ATG39Q06159 HAP3YBL021C 435 nt4.65□□□□□ -1.67
ATG39Q06159 YPL062WYPL062W 405 nt4.65□□□□□ -1.67
ATG39Q06159 PIF1YML061C 2580 nt4.65□□□□□ -1.67
ATG39Q06159 RPT2YDL007W 1314 nt4.65□□□□□ -1.67
ATG39Q06159 EEB1YPL095C 1371 nt4.65□□□□□ -1.67
ATG39Q06159 YHR182WYHR182W 2358 nt4.64□□□□□ -1.67
ATG39Q06159 PEX19YDL065C 1029 nt4.64□□□□□ -1.67
ATG39Q06159 RPN11YFR004W 921 nt4.64□□□□□ -1.67
ATG39Q06159 YIR020W-AYIR020W-A 243 nt4.64□□□□□ -1.67
ATG39Q06159 NRD1YNL251C 1728 nt4.63□□□□□ -1.67
ATG39Q06159 GRS1YBR121C 2004 nt4.63□□□□□ -1.67
ATG39Q06159 YDL129WYDL129W 876 nt4.63□□□□□ -1.67
ATG39Q06159 YDR053WYDR053W 396 nt4.63□□□□□ -1.67
ATG39Q06159 CAX4YGR036C 720 nt4.63□□□□□ -1.67
ATG39Q06159 GCV3YAL044C 513 nt4.63□□□□□ -1.67
ATG39Q06159 YNR040WYNR040W 771 nt4.63□□□□□ -1.67
ATG39Q06159 GAT1YFL021W 1533 nt4.62□□□□□ -1.67
ATG39Q06159 FRS2YFL022C 1512 nt4.62□□□□□ -1.67
ATG39Q06159 AFT1YGL071W 2073 nt4.62□□□□□ -1.67
ATG39Q06159 TUP1YCR084C 2142 nt4.62□□□□□ -1.67
ATG39Q06159 YER084WYER084W 387 nt4.62□□□□□ -1.67
ATG39Q06159 ECT1YGR007W 972 nt4.62□□□□□ -1.67
ATG39Q06159 MOG1YJR074W 657 nt4.62□□□□□ -1.67
ATG39Q06159 YNL042W-BYNL042W-B 258 nt4.62□□□□□ -1.67
ATG39Q06159 AVO1YOL078W 3531 nt4.62□□□□□ -1.67
ATG39Q06159 ADE6YGR061C 4077 nt4.62□□□□□ -1.67
ATG39Q06159 TUL1YKL034W 2277 nt4.62□□□□□ -1.67
ATG39Q06159 ATG4YNL223W 1485 nt4.62□□□□□ -1.67
ATG39Q06159 RAD24YER173W 1980 nt4.62□□□□□ -1.67
ATG39Q06159 SKS1YPL026C 1509 nt4.62□□□□□ -1.67
ATG39Q06159 NOC4YPR144C 1659 nt4.61□□□□□ -1.67
ATG39Q06159 STE20YHL007C 2820 nt4.61□□□□□ -1.67
ATG39Q06159 YDL121CYDL121C 450 nt4.61□□□□□ -1.67
ATG39Q06159 YDR401WYDR401W 564 nt4.61□□□□□ -1.67
ATG39Q06159 MED6YHR058C 888 nt4.61□□□□□ -1.67
ATG39Q06159 TAL1YLR354C 1008 nt4.61□□□□□ -1.67
ATG39Q06159 YPR160C-AYPR160C-A 285 nt4.61□□□□□ -1.67
ATG39Q06159 FET3YMR058W 1911 nt4.61□□□□□ -1.67
ATG39Q06159 YMR027WYMR027W 1413 nt4.61□□□□□ -1.67
ATG39Q06159 SNF3YDL194W 2655 nt4.6□□□□□ -1.67
ATG39Q06159 VNX1YNL321W 2727 nt4.6□□□□□ -1.67
ATG39Q06159 MCM3YEL032W 2916 nt4.6□□□□□ -1.67
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 37.7 ms