Protein–RNA interactions for Protein: Q05586

GRIN1, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 1, humanhuman

Predictions only

Length 938 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN1Q05586 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
GRIN1Q05586 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
GRIN1Q05586 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
GRIN1Q05586 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
GRIN1Q05586 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
GRIN1Q05586 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
GRIN1Q05586 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
GRIN1Q05586 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
GRIN1Q05586 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
GRIN1Q05586 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
GRIN1Q05586 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
GRIN1Q05586 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
GRIN1Q05586 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
GRIN1Q05586 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
GRIN1Q05586 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
GRIN1Q05586 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
GRIN1Q05586 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
GRIN1Q05586 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
GRIN1Q05586 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
GRIN1Q05586 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
GRIN1Q05586 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
GRIN1Q05586 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
GRIN1Q05586 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
GRIN1Q05586 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
GRIN1Q05586 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
GRIN1Q05586 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
GRIN1Q05586 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
GRIN1Q05586 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
GRIN1Q05586 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
GRIN1Q05586 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
GRIN1Q05586 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC26.7■■□□□ 1.87
GRIN1Q05586 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
GRIN1Q05586 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
GRIN1Q05586 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
GRIN1Q05586 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
GRIN1Q05586 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
GRIN1Q05586 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
GRIN1Q05586 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
GRIN1Q05586 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
GRIN1Q05586 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC26.69■■□□□ 1.86
GRIN1Q05586 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
GRIN1Q05586 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
GRIN1Q05586 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
GRIN1Q05586 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
GRIN1Q05586 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
GRIN1Q05586 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
GRIN1Q05586 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
GRIN1Q05586 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
GRIN1Q05586 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
GRIN1Q05586 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
GRIN1Q05586 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
GRIN1Q05586 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
GRIN1Q05586 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
GRIN1Q05586 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
GRIN1Q05586 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
GRIN1Q05586 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC26.67■■□□□ 1.86
GRIN1Q05586 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC26.67■■□□□ 1.86
GRIN1Q05586 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
GRIN1Q05586 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
GRIN1Q05586 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
GRIN1Q05586 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
GRIN1Q05586 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
GRIN1Q05586 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
GRIN1Q05586 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
GRIN1Q05586 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
GRIN1Q05586 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
GRIN1Q05586 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
GRIN1Q05586 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC26.65■■□□□ 1.86
GRIN1Q05586 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
GRIN1Q05586 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
GRIN1Q05586 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
GRIN1Q05586 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
GRIN1Q05586 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.86
GRIN1Q05586 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
GRIN1Q05586 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
GRIN1Q05586 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
GRIN1Q05586 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
GRIN1Q05586 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
GRIN1Q05586 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
GRIN1Q05586 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
GRIN1Q05586 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
GRIN1Q05586 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
GRIN1Q05586 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
GRIN1Q05586 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
GRIN1Q05586 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
GRIN1Q05586 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
GRIN1Q05586 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
GRIN1Q05586 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
GRIN1Q05586 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
GRIN1Q05586 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
GRIN1Q05586 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
GRIN1Q05586 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
GRIN1Q05586 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
GRIN1Q05586 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
GRIN1Q05586 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
GRIN1Q05586 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
GRIN1Q05586 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
GRIN1Q05586 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
GRIN1Q05586 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
GRIN1Q05586 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms