Protein–RNA interactions for Protein: Q04228

UBX2, UBX domain-containing protein 2, yeastyeast

Predictions only

Length 584 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
UBX2Q04228 YPL062WYPL062W 405 nt6.55□□□□□ -1.36
UBX2Q04228 CBC2YPL178W 627 nt6.55□□□□□ -1.36
UBX2Q04228 MTC1YJL123C 1437 nt6.55□□□□□ -1.36
UBX2Q04228 YEL020CYEL020C 1683 nt6.55□□□□□ -1.36
UBX2Q04228 PKC1YBL105C 3456 nt6.54□□□□□ -1.36
UBX2Q04228 MRS1YIR021W 1092 nt6.54□□□□□ -1.36
UBX2Q04228 STM1YLR150W 822 nt6.54□□□□□ -1.36
UBX2Q04228 UBP13YBL067C 2244 nt6.54□□□□□ -1.36
UBX2Q04228 AIM3YBR108W 2844 nt6.53□□□□□ -1.36
UBX2Q04228 YER148W-AYER148W-A 579 nt6.53□□□□□ -1.36
UBX2Q04228 tN(GUU)CtN(GUU)C 74 nt6.53□□□□□ -1.36
UBX2Q04228 tN(GUU)FtN(GUU)F 74 nt6.53□□□□□ -1.36
UBX2Q04228 tN(GUU)GtN(GUU)G 74 nt6.53□□□□□ -1.36
UBX2Q04228 tN(GUU)KtN(GUU)K 74 nt6.53□□□□□ -1.36
UBX2Q04228 tN(GUU)LtN(GUU)L 74 nt6.53□□□□□ -1.36
UBX2Q04228 tN(GUU)N1tN(GUU)N1 74 nt6.53□□□□□ -1.36
UBX2Q04228 tN(GUU)N2tN(GUU)N2 74 nt6.53□□□□□ -1.36
UBX2Q04228 tN(GUU)O1tN(GUU)O1 74 nt6.53□□□□□ -1.36
UBX2Q04228 tN(GUU)O2tN(GUU)O2 74 nt6.53□□□□□ -1.36
UBX2Q04228 tN(GUU)PtN(GUU)P 74 nt6.53□□□□□ -1.36
UBX2Q04228 YNL019CYNL019C 855 nt6.53□□□□□ -1.36
UBX2Q04228 YNL033WYNL033W 855 nt6.53□□□□□ -1.36
UBX2Q04228 MMP1YLL061W 1752 nt6.53□□□□□ -1.36
UBX2Q04228 EFM3YJR129C 1020 nt6.52□□□□□ -1.37
UBX2Q04228 YAL056C-AYAL056C-A 351 nt6.52□□□□□ -1.37
UBX2Q04228 PGA3YML125C 939 nt6.52□□□□□ -1.37
UBX2Q04228 YPR123CYPR123C 435 nt6.52□□□□□ -1.37
UBX2Q04228 MLC2YPR188C 492 nt6.52□□□□□ -1.37
UBX2Q04228 HSP78YDR258C 2436 nt6.51□□□□□ -1.37
UBX2Q04228 YNL296WYNL296W 315 nt6.5□□□□□ -1.37
UBX2Q04228 ERC1YHR032W 1746 nt6.5□□□□□ -1.37
UBX2Q04228 PTK2YJR059W 2457 nt6.5□□□□□ -1.37
UBX2Q04228 GPA1YHR005C 1419 nt6.5□□□□□ -1.37
UBX2Q04228 AMA1YGR225W 1782 nt6.49□□□□□ -1.37
UBX2Q04228 ALT1YLR089C 1779 nt6.49□□□□□ -1.37
UBX2Q04228 YFL042CYFL042C 2025 nt6.49□□□□□ -1.37
UBX2Q04228 VPS5YOR069W 2028 nt6.49□□□□□ -1.37
UBX2Q04228 YCR075W-AYCR075W-A 228 nt6.48□□□□□ -1.37
UBX2Q04228 SNZ3YFL059W 897 nt6.48□□□□□ -1.37
UBX2Q04228 SCW4YGR279C 1161 nt6.48□□□□□ -1.37
UBX2Q04228 SNZ2YNL333W 897 nt6.48□□□□□ -1.37
UBX2Q04228 TRK2YKR050W 2670 nt6.48□□□□□ -1.37
UBX2Q04228 SHE10YGL228W 1734 nt6.47□□□□□ -1.37
UBX2Q04228 CLB2YPR119W 1476 nt6.47□□□□□ -1.37
UBX2Q04228 YFR034W-AYFR034W-A 288 nt6.47□□□□□ -1.37
UBX2Q04228 PHO8YDR481C 1701 nt6.47□□□□□ -1.37
UBX2Q04228 GAT1YFL021W 1533 nt6.46□□□□□ -1.37
UBX2Q04228 YKR023WYKR023W 1593 nt6.46□□□□□ -1.38
UBX2Q04228 COT1YOR316C 1320 nt6.46□□□□□ -1.38
UBX2Q04228 LDB19YOR322C 2457 nt6.45□□□□□ -1.38
UBX2Q04228 MCM6YGL201C 3054 nt6.45□□□□□ -1.38
UBX2Q04228 POM33YLL023C 840 nt6.45□□□□□ -1.38
UBX2Q04228 SCO2YBR024W 906 nt6.45□□□□□ -1.38
UBX2Q04228 TEF1YPR080W 1377 nt6.44□□□□□ -1.38
UBX2Q04228 TEF2YBR118W 1377 nt6.44□□□□□ -1.38
UBX2Q04228 DPH2YKL191W 1605 nt6.44□□□□□ -1.38
UBX2Q04228 UTR4YEL038W 684 nt6.44□□□□□ -1.38
UBX2Q04228 YHC3YJL059W 1227 nt6.44□□□□□ -1.38
UBX2Q04228 RPS15YOL040C 429 nt6.44□□□□□ -1.38
UBX2Q04228 VPS4YPR173C 1314 nt6.44□□□□□ -1.38
UBX2Q04228 CBF1YJR060W 1056 nt6.43□□□□□ -1.38
UBX2Q04228 UGO1YDR470C 1509 nt6.43□□□□□ -1.38
UBX2Q04228 BUL1YMR275C 2931 nt6.43□□□□□ -1.38
UBX2Q04228 IPI1YHR085W 1005 nt6.42□□□□□ -1.38
UBX2Q04228 MRPL4YLR439W 960 nt6.42□□□□□ -1.38
UBX2Q04228 BBP1YPL255W 1158 nt6.42□□□□□ -1.38
UBX2Q04228 YPR195CYPR195C 330 nt6.42□□□□□ -1.38
UBX2Q04228 HSP104YLL026W 2727 nt6.42□□□□□ -1.38
UBX2Q04228 SMF2YHR050W 1650 nt6.42□□□□□ -1.38
UBX2Q04228 VPS70YJR126C 2436 nt6.41□□□□□ -1.38
UBX2Q04228 STE13YOR219C 2796 nt6.41□□□□□ -1.38
UBX2Q04228 TAL1YLR354C 1008 nt6.41□□□□□ -1.38
UBX2Q04228 ALD6YPL061W 1503 nt6.4□□□□□ -1.38
UBX2Q04228 YHR127WYHR127W 732 nt6.4□□□□□ -1.38
UBX2Q04228 EEB1YPL095C 1371 nt6.4□□□□□ -1.39
UBX2Q04228 MID1YNL291C 1647 nt6.39□□□□□ -1.39
UBX2Q04228 YEL053W-AYEL053W-A 348 nt6.39□□□□□ -1.39
UBX2Q04228 RPL7AYGL076C 735 nt6.39□□□□□ -1.39
UBX2Q04228 RHO4YKR055W 876 nt6.39□□□□□ -1.39
UBX2Q04228 YNR048WYNR048W 1182 nt6.39□□□□□ -1.39
UBX2Q04228 ETR1YBR026C 1143 nt6.39□□□□□ -1.39
UBX2Q04228 RPL7BYPL198W 735 nt6.39□□□□□ -1.39
UBX2Q04228 RPT1YKL145W 1404 nt6.39□□□□□ -1.39
UBX2Q04228 TOS4YLR183C 1470 nt6.39□□□□□ -1.39
UBX2Q04228 YHR045WYHR045W 1683 nt6.39□□□□□ -1.39
UBX2Q04228 YAP1YML007W 1953 nt6.38□□□□□ -1.39
UBX2Q04228 SCT1YBL011W 2280 nt6.38□□□□□ -1.39
UBX2Q04228 HXT15YDL245C 1704 nt6.37□□□□□ -1.39
UBX2Q04228 HXT16YJR158W 1704 nt6.37□□□□□ -1.39
UBX2Q04228 GEP3YOR205C 1671 nt6.37□□□□□ -1.39
UBX2Q04228 MKK2YPL140C 1521 nt6.37□□□□□ -1.39
UBX2Q04228 RER2YBR002C 861 nt6.37□□□□□ -1.39
UBX2Q04228 VMA4YOR332W 702 nt6.37□□□□□ -1.39
UBX2Q04228 KEX2YNL238W 2445 nt6.37□□□□□ -1.39
UBX2Q04228 SGV1YPR161C 1974 nt6.37□□□□□ -1.39
UBX2Q04228 THI21YPL258C 1656 nt6.36□□□□□ -1.39
UBX2Q04228 OST3YOR085W 1053 nt6.36□□□□□ -1.39
UBX2Q04228 SNT2YGL131C 4212 nt6.36□□□□□ -1.39
UBX2Q04228 HAL5YJL165C 2568 nt6.36□□□□□ -1.39
UBX2Q04228 TAX4YJL083W 1815 nt6.36□□□□□ -1.39
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 11.7 ms