Protein–RNA interactions for Protein: Q02487

DSC2, Desmocollin-2, humanhuman

Predictions only

Length 901 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSC2Q02487 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
DSC2Q02487 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
DSC2Q02487 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
DSC2Q02487 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
DSC2Q02487 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
DSC2Q02487 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
DSC2Q02487 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
DSC2Q02487 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
DSC2Q02487 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
DSC2Q02487 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
DSC2Q02487 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
DSC2Q02487 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
DSC2Q02487 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
DSC2Q02487 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
DSC2Q02487 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
DSC2Q02487 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
DSC2Q02487 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
DSC2Q02487 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
DSC2Q02487 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
DSC2Q02487 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
DSC2Q02487 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
DSC2Q02487 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
DSC2Q02487 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
DSC2Q02487 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
DSC2Q02487 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
DSC2Q02487 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
DSC2Q02487 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
DSC2Q02487 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
DSC2Q02487 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
DSC2Q02487 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
DSC2Q02487 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
DSC2Q02487 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
DSC2Q02487 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
DSC2Q02487 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
DSC2Q02487 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
DSC2Q02487 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
DSC2Q02487 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
DSC2Q02487 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
DSC2Q02487 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
DSC2Q02487 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
DSC2Q02487 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
DSC2Q02487 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
DSC2Q02487 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
DSC2Q02487 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
DSC2Q02487 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
DSC2Q02487 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
DSC2Q02487 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
DSC2Q02487 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
DSC2Q02487 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
DSC2Q02487 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
DSC2Q02487 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
DSC2Q02487 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
DSC2Q02487 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
DSC2Q02487 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
DSC2Q02487 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
DSC2Q02487 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
DSC2Q02487 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
DSC2Q02487 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
DSC2Q02487 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
DSC2Q02487 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
DSC2Q02487 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
DSC2Q02487 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
DSC2Q02487 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
DSC2Q02487 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
DSC2Q02487 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
DSC2Q02487 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
DSC2Q02487 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
DSC2Q02487 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
DSC2Q02487 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
DSC2Q02487 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
DSC2Q02487 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
DSC2Q02487 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
DSC2Q02487 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
DSC2Q02487 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
DSC2Q02487 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
DSC2Q02487 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
DSC2Q02487 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
DSC2Q02487 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
DSC2Q02487 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
DSC2Q02487 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
DSC2Q02487 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
DSC2Q02487 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
DSC2Q02487 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
DSC2Q02487 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
DSC2Q02487 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
DSC2Q02487 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
DSC2Q02487 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
DSC2Q02487 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
DSC2Q02487 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
DSC2Q02487 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
DSC2Q02487 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
DSC2Q02487 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
DSC2Q02487 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
DSC2Q02487 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
DSC2Q02487 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
DSC2Q02487 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
DSC2Q02487 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
DSC2Q02487 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
DSC2Q02487 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
DSC2Q02487 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms