Protein–RNA interactions for Protein: Q02224

CENPE, Centromere-associated protein E, humanhuman

Predictions only

Length 2,701 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPEQ02224 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CENPEQ02224 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CENPEQ02224 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CENPEQ02224 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CENPEQ02224 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CENPEQ02224 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
CENPEQ02224 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
CENPEQ02224 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CENPEQ02224 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CENPEQ02224 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CENPEQ02224 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CENPEQ02224 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
CENPEQ02224 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CENPEQ02224 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CENPEQ02224 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CENPEQ02224 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CENPEQ02224 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CENPEQ02224 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CENPEQ02224 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CENPEQ02224 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CENPEQ02224 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CENPEQ02224 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CENPEQ02224 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CENPEQ02224 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CENPEQ02224 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CENPEQ02224 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CENPEQ02224 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CENPEQ02224 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CENPEQ02224 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CENPEQ02224 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CENPEQ02224 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CENPEQ02224 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CENPEQ02224 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CENPEQ02224 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CENPEQ02224 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CENPEQ02224 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
CENPEQ02224 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CENPEQ02224 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CENPEQ02224 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
CENPEQ02224 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.87
CENPEQ02224 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC20.52■□□□□ 0.87
CENPEQ02224 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CENPEQ02224 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CENPEQ02224 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
CENPEQ02224 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CENPEQ02224 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CENPEQ02224 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CENPEQ02224 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CENPEQ02224 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CENPEQ02224 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CENPEQ02224 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CENPEQ02224 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CENPEQ02224 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CENPEQ02224 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CENPEQ02224 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CENPEQ02224 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CENPEQ02224 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CENPEQ02224 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CENPEQ02224 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CENPEQ02224 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CENPEQ02224 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CENPEQ02224 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
CENPEQ02224 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CENPEQ02224 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CENPEQ02224 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CENPEQ02224 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CENPEQ02224 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CENPEQ02224 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CENPEQ02224 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
CENPEQ02224 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CENPEQ02224 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CENPEQ02224 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CENPEQ02224 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CENPEQ02224 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
CENPEQ02224 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CENPEQ02224 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CENPEQ02224 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CENPEQ02224 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CENPEQ02224 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CENPEQ02224 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CENPEQ02224 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CENPEQ02224 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CENPEQ02224 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CENPEQ02224 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CENPEQ02224 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CENPEQ02224 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CENPEQ02224 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CENPEQ02224 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CENPEQ02224 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CENPEQ02224 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CENPEQ02224 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CENPEQ02224 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CENPEQ02224 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CENPEQ02224 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CENPEQ02224 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CENPEQ02224 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CENPEQ02224 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CENPEQ02224 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CENPEQ02224 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CENPEQ02224 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 118.1 ms