Protein–RNA interactions for Protein: P84077

ARF1, ADP-ribosylation factor 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARF1P84077 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ARF1P84077 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ARF1P84077 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ARF1P84077 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
ARF1P84077 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ARF1P84077 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
ARF1P84077 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
ARF1P84077 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
ARF1P84077 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ARF1P84077 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
ARF1P84077 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
ARF1P84077 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ARF1P84077 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
ARF1P84077 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ARF1P84077 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
ARF1P84077 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
ARF1P84077 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ARF1P84077 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ARF1P84077 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
ARF1P84077 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ARF1P84077 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ARF1P84077 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
ARF1P84077 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
ARF1P84077 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
ARF1P84077 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
ARF1P84077 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ARF1P84077 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ARF1P84077 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
ARF1P84077 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
ARF1P84077 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ARF1P84077 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ARF1P84077 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
ARF1P84077 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ARF1P84077 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ARF1P84077 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ARF1P84077 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ARF1P84077 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ARF1P84077 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ARF1P84077 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ARF1P84077 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ARF1P84077 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ARF1P84077 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ARF1P84077 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ARF1P84077 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ARF1P84077 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ARF1P84077 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ARF1P84077 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ARF1P84077 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ARF1P84077 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ARF1P84077 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ARF1P84077 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ARF1P84077 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ARF1P84077 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ARF1P84077 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ARF1P84077 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ARF1P84077 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ARF1P84077 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ARF1P84077 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
ARF1P84077 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ARF1P84077 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ARF1P84077 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ARF1P84077 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ARF1P84077 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ARF1P84077 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ARF1P84077 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ARF1P84077 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ARF1P84077 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ARF1P84077 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ARF1P84077 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ARF1P84077 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ARF1P84077 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ARF1P84077 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
ARF1P84077 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
ARF1P84077 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ARF1P84077 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
ARF1P84077 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
ARF1P84077 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ARF1P84077 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
ARF1P84077 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ARF1P84077 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ARF1P84077 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ARF1P84077 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ARF1P84077 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
ARF1P84077 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
ARF1P84077 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
ARF1P84077 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
ARF1P84077 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
ARF1P84077 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ARF1P84077 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
ARF1P84077 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
ARF1P84077 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ARF1P84077 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
ARF1P84077 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ARF1P84077 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
ARF1P84077 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
ARF1P84077 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ARF1P84077 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
ARF1P84077 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
ARF1P84077 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
ARF1P84077 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.2 ms