Protein–RNA interactions for Protein: P81877

SSBP2, Single-stranded DNA-binding protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSBP2P81877 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
SSBP2P81877 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
SSBP2P81877 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
SSBP2P81877 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SSBP2P81877 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SSBP2P81877 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SSBP2P81877 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
SSBP2P81877 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
SSBP2P81877 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SSBP2P81877 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SSBP2P81877 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
SSBP2P81877 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SSBP2P81877 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
SSBP2P81877 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SSBP2P81877 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
SSBP2P81877 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SSBP2P81877 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
SSBP2P81877 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SSBP2P81877 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
SSBP2P81877 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SSBP2P81877 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SSBP2P81877 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SSBP2P81877 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SSBP2P81877 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SSBP2P81877 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SSBP2P81877 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SSBP2P81877 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SSBP2P81877 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SSBP2P81877 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SSBP2P81877 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SSBP2P81877 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
SSBP2P81877 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SSBP2P81877 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SSBP2P81877 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SSBP2P81877 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SSBP2P81877 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SSBP2P81877 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
SSBP2P81877 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SSBP2P81877 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SSBP2P81877 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SSBP2P81877 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SSBP2P81877 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SSBP2P81877 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SSBP2P81877 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SSBP2P81877 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SSBP2P81877 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SSBP2P81877 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SSBP2P81877 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SSBP2P81877 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SSBP2P81877 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SSBP2P81877 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SSBP2P81877 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SSBP2P81877 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SSBP2P81877 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SSBP2P81877 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
SSBP2P81877 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
SSBP2P81877 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SSBP2P81877 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SSBP2P81877 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SSBP2P81877 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SSBP2P81877 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SSBP2P81877 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SSBP2P81877 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
SSBP2P81877 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.59
SSBP2P81877 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SSBP2P81877 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SSBP2P81877 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SSBP2P81877 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SSBP2P81877 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SSBP2P81877 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
SSBP2P81877 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SSBP2P81877 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
SSBP2P81877 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SSBP2P81877 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SSBP2P81877 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SSBP2P81877 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SSBP2P81877 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SSBP2P81877 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SSBP2P81877 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SSBP2P81877 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SSBP2P81877 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SSBP2P81877 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
SSBP2P81877 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SSBP2P81877 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SSBP2P81877 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SSBP2P81877 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SSBP2P81877 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SSBP2P81877 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SSBP2P81877 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SSBP2P81877 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SSBP2P81877 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SSBP2P81877 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SSBP2P81877 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SSBP2P81877 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SSBP2P81877 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SSBP2P81877 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
SSBP2P81877 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SSBP2P81877 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SSBP2P81877 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SSBP2P81877 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms