Protein–RNA interactions for Protein: P78369

CLDN10, Claudin-10, humanhuman

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN10P78369 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CLDN10P78369 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CLDN10P78369 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CLDN10P78369 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CLDN10P78369 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
CLDN10P78369 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CLDN10P78369 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
CLDN10P78369 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CLDN10P78369 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CLDN10P78369 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CLDN10P78369 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CLDN10P78369 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CLDN10P78369 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CLDN10P78369 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CLDN10P78369 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CLDN10P78369 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CLDN10P78369 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CLDN10P78369 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CLDN10P78369 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CLDN10P78369 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CLDN10P78369 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CLDN10P78369 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CLDN10P78369 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
CLDN10P78369 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CLDN10P78369 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CLDN10P78369 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CLDN10P78369 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CLDN10P78369 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CLDN10P78369 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CLDN10P78369 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CLDN10P78369 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CLDN10P78369 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CLDN10P78369 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CLDN10P78369 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CLDN10P78369 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CLDN10P78369 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CLDN10P78369 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CLDN10P78369 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CLDN10P78369 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CLDN10P78369 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
CLDN10P78369 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CLDN10P78369 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
CLDN10P78369 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CLDN10P78369 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CLDN10P78369 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CLDN10P78369 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CLDN10P78369 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CLDN10P78369 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CLDN10P78369 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CLDN10P78369 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CLDN10P78369 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CLDN10P78369 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CLDN10P78369 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CLDN10P78369 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
CLDN10P78369 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CLDN10P78369 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CLDN10P78369 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CLDN10P78369 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CLDN10P78369 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CLDN10P78369 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
CLDN10P78369 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CLDN10P78369 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CLDN10P78369 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CLDN10P78369 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CLDN10P78369 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
CLDN10P78369 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CLDN10P78369 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CLDN10P78369 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CLDN10P78369 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CLDN10P78369 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CLDN10P78369 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CLDN10P78369 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CLDN10P78369 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CLDN10P78369 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CLDN10P78369 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CLDN10P78369 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CLDN10P78369 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CLDN10P78369 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CLDN10P78369 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CLDN10P78369 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CLDN10P78369 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CLDN10P78369 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC25.45■■□□□ 1.67
CLDN10P78369 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CLDN10P78369 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CLDN10P78369 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CLDN10P78369 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CLDN10P78369 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CLDN10P78369 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CLDN10P78369 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CLDN10P78369 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CLDN10P78369 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CLDN10P78369 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CLDN10P78369 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CLDN10P78369 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
CLDN10P78369 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
CLDN10P78369 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
CLDN10P78369 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CLDN10P78369 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CLDN10P78369 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CLDN10P78369 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms