Protein–RNA interactions for Protein: P78368

CSNK1G2, Casein kinase I isoform gamma-2, humanhuman

Predictions only

Length 415 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSNK1G2P78368 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CSNK1G2P78368 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CSNK1G2P78368 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CSNK1G2P78368 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CSNK1G2P78368 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CSNK1G2P78368 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CSNK1G2P78368 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CSNK1G2P78368 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CSNK1G2P78368 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CSNK1G2P78368 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CSNK1G2P78368 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CSNK1G2P78368 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CSNK1G2P78368 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CSNK1G2P78368 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CSNK1G2P78368 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CSNK1G2P78368 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CSNK1G2P78368 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CSNK1G2P78368 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CSNK1G2P78368 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CSNK1G2P78368 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CSNK1G2P78368 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CSNK1G2P78368 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CSNK1G2P78368 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CSNK1G2P78368 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CSNK1G2P78368 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CSNK1G2P78368 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CSNK1G2P78368 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CSNK1G2P78368 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CSNK1G2P78368 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CSNK1G2P78368 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CSNK1G2P78368 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CSNK1G2P78368 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
CSNK1G2P78368 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CSNK1G2P78368 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CSNK1G2P78368 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CSNK1G2P78368 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CSNK1G2P78368 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CSNK1G2P78368 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CSNK1G2P78368 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CSNK1G2P78368 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CSNK1G2P78368 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CSNK1G2P78368 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CSNK1G2P78368 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CSNK1G2P78368 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CSNK1G2P78368 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CSNK1G2P78368 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
CSNK1G2P78368 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CSNK1G2P78368 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CSNK1G2P78368 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CSNK1G2P78368 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CSNK1G2P78368 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CSNK1G2P78368 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CSNK1G2P78368 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CSNK1G2P78368 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CSNK1G2P78368 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
CSNK1G2P78368 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CSNK1G2P78368 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CSNK1G2P78368 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CSNK1G2P78368 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CSNK1G2P78368 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CSNK1G2P78368 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CSNK1G2P78368 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CSNK1G2P78368 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CSNK1G2P78368 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CSNK1G2P78368 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CSNK1G2P78368 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CSNK1G2P78368 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CSNK1G2P78368 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CSNK1G2P78368 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CSNK1G2P78368 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CSNK1G2P78368 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CSNK1G2P78368 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CSNK1G2P78368 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CSNK1G2P78368 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CSNK1G2P78368 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CSNK1G2P78368 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CSNK1G2P78368 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CSNK1G2P78368 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CSNK1G2P78368 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CSNK1G2P78368 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CSNK1G2P78368 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CSNK1G2P78368 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CSNK1G2P78368 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CSNK1G2P78368 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CSNK1G2P78368 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CSNK1G2P78368 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CSNK1G2P78368 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CSNK1G2P78368 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CSNK1G2P78368 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CSNK1G2P78368 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CSNK1G2P78368 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
CSNK1G2P78368 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CSNK1G2P78368 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CSNK1G2P78368 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CSNK1G2P78368 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CSNK1G2P78368 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CSNK1G2P78368 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CSNK1G2P78368 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CSNK1G2P78368 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CSNK1G2P78368 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14 ms