Protein–RNA interactions for Protein: P63316

TNNC1, Troponin C, slow skeletal and cardiac muscles, humanhuman

Predictions only

Length 161 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNC1P63316 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TNNC1P63316 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TNNC1P63316 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
TNNC1P63316 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TNNC1P63316 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
TNNC1P63316 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TNNC1P63316 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TNNC1P63316 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TNNC1P63316 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
TNNC1P63316 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TNNC1P63316 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
TNNC1P63316 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TNNC1P63316 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TNNC1P63316 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
TNNC1P63316 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
TNNC1P63316 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TNNC1P63316 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TNNC1P63316 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TNNC1P63316 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
TNNC1P63316 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
TNNC1P63316 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
TNNC1P63316 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
TNNC1P63316 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
TNNC1P63316 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
TNNC1P63316 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
TNNC1P63316 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
TNNC1P63316 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.69
TNNC1P63316 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
TNNC1P63316 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
TNNC1P63316 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
TNNC1P63316 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TNNC1P63316 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
TNNC1P63316 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
TNNC1P63316 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TNNC1P63316 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TNNC1P63316 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TNNC1P63316 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
TNNC1P63316 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TNNC1P63316 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
TNNC1P63316 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TNNC1P63316 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TNNC1P63316 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TNNC1P63316 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TNNC1P63316 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TNNC1P63316 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TNNC1P63316 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TNNC1P63316 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TNNC1P63316 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
TNNC1P63316 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TNNC1P63316 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TNNC1P63316 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TNNC1P63316 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TNNC1P63316 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
TNNC1P63316 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
TNNC1P63316 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
TNNC1P63316 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TNNC1P63316 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TNNC1P63316 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TNNC1P63316 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
TNNC1P63316 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TNNC1P63316 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TNNC1P63316 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
TNNC1P63316 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
TNNC1P63316 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TNNC1P63316 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TNNC1P63316 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
TNNC1P63316 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
TNNC1P63316 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
TNNC1P63316 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
TNNC1P63316 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
TNNC1P63316 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
TNNC1P63316 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TNNC1P63316 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TNNC1P63316 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TNNC1P63316 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.68
TNNC1P63316 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
TNNC1P63316 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
TNNC1P63316 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
TNNC1P63316 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TNNC1P63316 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
TNNC1P63316 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TNNC1P63316 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TNNC1P63316 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
TNNC1P63316 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
TNNC1P63316 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TNNC1P63316 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TNNC1P63316 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
TNNC1P63316 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
TNNC1P63316 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TNNC1P63316 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TNNC1P63316 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TNNC1P63316 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TNNC1P63316 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TNNC1P63316 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TNNC1P63316 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TNNC1P63316 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TNNC1P63316 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TNNC1P63316 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TNNC1P63316 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TNNC1P63316 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms