Protein–RNA interactions for Protein: P63279

UBE2I, SUMO-conjugating enzyme UBC9, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 158 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2IP63279 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
UBE2IP63279 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
UBE2IP63279 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
UBE2IP63279 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
UBE2IP63279 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
UBE2IP63279 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
UBE2IP63279 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
UBE2IP63279 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
UBE2IP63279 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
UBE2IP63279 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
UBE2IP63279 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
UBE2IP63279 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
UBE2IP63279 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
UBE2IP63279 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
UBE2IP63279 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
UBE2IP63279 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
UBE2IP63279 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
UBE2IP63279 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
UBE2IP63279 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
UBE2IP63279 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
UBE2IP63279 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
UBE2IP63279 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
UBE2IP63279 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
UBE2IP63279 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
UBE2IP63279 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
UBE2IP63279 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
UBE2IP63279 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
UBE2IP63279 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
UBE2IP63279 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
UBE2IP63279 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
UBE2IP63279 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC22.91■■□□□ 1.26
UBE2IP63279 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC22.91■■□□□ 1.26
UBE2IP63279 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
UBE2IP63279 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
UBE2IP63279 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
UBE2IP63279 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
UBE2IP63279 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
UBE2IP63279 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
UBE2IP63279 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
UBE2IP63279 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
UBE2IP63279 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
UBE2IP63279 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
UBE2IP63279 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
UBE2IP63279 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
UBE2IP63279 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
UBE2IP63279 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
UBE2IP63279 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
UBE2IP63279 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
UBE2IP63279 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
UBE2IP63279 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
UBE2IP63279 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
UBE2IP63279 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
UBE2IP63279 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
UBE2IP63279 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
UBE2IP63279 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
UBE2IP63279 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
UBE2IP63279 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
UBE2IP63279 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
UBE2IP63279 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
UBE2IP63279 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC22.88■■□□□ 1.25
UBE2IP63279 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
UBE2IP63279 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
UBE2IP63279 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
UBE2IP63279 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
UBE2IP63279 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
UBE2IP63279 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
UBE2IP63279 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
UBE2IP63279 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
UBE2IP63279 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
UBE2IP63279 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
UBE2IP63279 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
UBE2IP63279 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
UBE2IP63279 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
UBE2IP63279 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
UBE2IP63279 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
UBE2IP63279 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
UBE2IP63279 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
UBE2IP63279 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
UBE2IP63279 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
UBE2IP63279 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
UBE2IP63279 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
UBE2IP63279 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
UBE2IP63279 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
UBE2IP63279 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
UBE2IP63279 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
UBE2IP63279 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
UBE2IP63279 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
UBE2IP63279 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
UBE2IP63279 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
UBE2IP63279 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
UBE2IP63279 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
UBE2IP63279 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
UBE2IP63279 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
UBE2IP63279 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
UBE2IP63279 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
UBE2IP63279 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
UBE2IP63279 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
UBE2IP63279 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
UBE2IP63279 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
UBE2IP63279 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86.4 ms