Protein–RNA interactions for Protein: P61163

ACTR1A, Alpha-centractin, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTR1AP61163 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ACTR1AP61163 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ACTR1AP61163 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ACTR1AP61163 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ACTR1AP61163 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ACTR1AP61163 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
ACTR1AP61163 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
ACTR1AP61163 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
ACTR1AP61163 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
ACTR1AP61163 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ACTR1AP61163 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ACTR1AP61163 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
ACTR1AP61163 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ACTR1AP61163 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ACTR1AP61163 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ACTR1AP61163 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ACTR1AP61163 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ACTR1AP61163 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ACTR1AP61163 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ACTR1AP61163 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ACTR1AP61163 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ACTR1AP61163 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ACTR1AP61163 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ACTR1AP61163 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ACTR1AP61163 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ACTR1AP61163 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ACTR1AP61163 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ACTR1AP61163 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ACTR1AP61163 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ACTR1AP61163 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ACTR1AP61163 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ACTR1AP61163 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ACTR1AP61163 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ACTR1AP61163 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
ACTR1AP61163 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
ACTR1AP61163 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ACTR1AP61163 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ACTR1AP61163 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ACTR1AP61163 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ACTR1AP61163 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ACTR1AP61163 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ACTR1AP61163 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ACTR1AP61163 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ACTR1AP61163 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ACTR1AP61163 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ACTR1AP61163 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ACTR1AP61163 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ACTR1AP61163 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ACTR1AP61163 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
ACTR1AP61163 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
ACTR1AP61163 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ACTR1AP61163 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ACTR1AP61163 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ACTR1AP61163 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ACTR1AP61163 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ACTR1AP61163 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ACTR1AP61163 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ACTR1AP61163 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ACTR1AP61163 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ACTR1AP61163 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
ACTR1AP61163 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ACTR1AP61163 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
ACTR1AP61163 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
ACTR1AP61163 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ACTR1AP61163 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ACTR1AP61163 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ACTR1AP61163 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ACTR1AP61163 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ACTR1AP61163 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ACTR1AP61163 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ACTR1AP61163 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ACTR1AP61163 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ACTR1AP61163 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ACTR1AP61163 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ACTR1AP61163 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ACTR1AP61163 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ACTR1AP61163 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ACTR1AP61163 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ACTR1AP61163 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ACTR1AP61163 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ACTR1AP61163 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ACTR1AP61163 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ACTR1AP61163 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ACTR1AP61163 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ACTR1AP61163 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ACTR1AP61163 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ACTR1AP61163 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ACTR1AP61163 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ACTR1AP61163 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ACTR1AP61163 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ACTR1AP61163 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ACTR1AP61163 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ACTR1AP61163 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ACTR1AP61163 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ACTR1AP61163 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ACTR1AP61163 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
ACTR1AP61163 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
ACTR1AP61163 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ACTR1AP61163 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ACTR1AP61163 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms