Protein–RNA interactions for Protein: P61006

RAB8A, Ras-related protein Rab-8A, humanhuman

Predictions only

Length 207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB8AP61006 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RAB8AP61006 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RAB8AP61006 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RAB8AP61006 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RAB8AP61006 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RAB8AP61006 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RAB8AP61006 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RAB8AP61006 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RAB8AP61006 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
RAB8AP61006 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RAB8AP61006 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RAB8AP61006 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RAB8AP61006 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
RAB8AP61006 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RAB8AP61006 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RAB8AP61006 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RAB8AP61006 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RAB8AP61006 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RAB8AP61006 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RAB8AP61006 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RAB8AP61006 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RAB8AP61006 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RAB8AP61006 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RAB8AP61006 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RAB8AP61006 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RAB8AP61006 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RAB8AP61006 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RAB8AP61006 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RAB8AP61006 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RAB8AP61006 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RAB8AP61006 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RAB8AP61006 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RAB8AP61006 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
RAB8AP61006 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
RAB8AP61006 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
RAB8AP61006 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RAB8AP61006 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RAB8AP61006 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RAB8AP61006 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RAB8AP61006 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RAB8AP61006 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RAB8AP61006 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RAB8AP61006 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RAB8AP61006 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RAB8AP61006 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RAB8AP61006 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RAB8AP61006 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RAB8AP61006 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RAB8AP61006 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RAB8AP61006 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RAB8AP61006 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RAB8AP61006 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RAB8AP61006 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RAB8AP61006 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RAB8AP61006 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RAB8AP61006 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RAB8AP61006 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RAB8AP61006 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RAB8AP61006 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RAB8AP61006 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RAB8AP61006 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RAB8AP61006 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RAB8AP61006 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RAB8AP61006 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RAB8AP61006 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RAB8AP61006 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RAB8AP61006 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RAB8AP61006 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RAB8AP61006 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RAB8AP61006 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RAB8AP61006 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
RAB8AP61006 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RAB8AP61006 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RAB8AP61006 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RAB8AP61006 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RAB8AP61006 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RAB8AP61006 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RAB8AP61006 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RAB8AP61006 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RAB8AP61006 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RAB8AP61006 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
RAB8AP61006 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RAB8AP61006 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RAB8AP61006 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
RAB8AP61006 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RAB8AP61006 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RAB8AP61006 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RAB8AP61006 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RAB8AP61006 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RAB8AP61006 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RAB8AP61006 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RAB8AP61006 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RAB8AP61006 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RAB8AP61006 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RAB8AP61006 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RAB8AP61006 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RAB8AP61006 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RAB8AP61006 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RAB8AP61006 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RAB8AP61006 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.8 ms