Protein–RNA interactions for Protein: P60508

ERVFRD-1, Syncytin-2, humanhuman

Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVFRD-1P60508 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC19.68■□□□□ 0.74
ERVFRD-1P60508 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
ERVFRD-1P60508 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
ERVFRD-1P60508 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
ERVFRD-1P60508 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
ERVFRD-1P60508 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
ERVFRD-1P60508 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
ERVFRD-1P60508 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
ERVFRD-1P60508 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
ERVFRD-1P60508 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
ERVFRD-1P60508 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
ERVFRD-1P60508 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
ERVFRD-1P60508 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
ERVFRD-1P60508 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
ERVFRD-1P60508 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
ERVFRD-1P60508 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
ERVFRD-1P60508 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
ERVFRD-1P60508 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
ERVFRD-1P60508 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
ERVFRD-1P60508 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
ERVFRD-1P60508 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
ERVFRD-1P60508 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
ERVFRD-1P60508 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
ERVFRD-1P60508 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
ERVFRD-1P60508 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
ERVFRD-1P60508 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
ERVFRD-1P60508 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
ERVFRD-1P60508 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
ERVFRD-1P60508 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
ERVFRD-1P60508 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
ERVFRD-1P60508 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
ERVFRD-1P60508 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
ERVFRD-1P60508 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
ERVFRD-1P60508 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.74
ERVFRD-1P60508 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
ERVFRD-1P60508 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
ERVFRD-1P60508 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
ERVFRD-1P60508 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
ERVFRD-1P60508 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
ERVFRD-1P60508 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
ERVFRD-1P60508 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
ERVFRD-1P60508 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
ERVFRD-1P60508 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
ERVFRD-1P60508 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
ERVFRD-1P60508 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
ERVFRD-1P60508 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
ERVFRD-1P60508 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
ERVFRD-1P60508 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
ERVFRD-1P60508 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
ERVFRD-1P60508 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
ERVFRD-1P60508 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
ERVFRD-1P60508 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
ERVFRD-1P60508 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
ERVFRD-1P60508 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
ERVFRD-1P60508 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
ERVFRD-1P60508 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
ERVFRD-1P60508 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
ERVFRD-1P60508 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
ERVFRD-1P60508 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
ERVFRD-1P60508 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
ERVFRD-1P60508 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
ERVFRD-1P60508 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
ERVFRD-1P60508 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
ERVFRD-1P60508 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
ERVFRD-1P60508 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
ERVFRD-1P60508 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
ERVFRD-1P60508 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ERVFRD-1P60508 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ERVFRD-1P60508 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
ERVFRD-1P60508 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
ERVFRD-1P60508 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
ERVFRD-1P60508 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ERVFRD-1P60508 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
ERVFRD-1P60508 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ERVFRD-1P60508 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ERVFRD-1P60508 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC19.6■□□□□ 0.73
ERVFRD-1P60508 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ERVFRD-1P60508 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ERVFRD-1P60508 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
ERVFRD-1P60508 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ERVFRD-1P60508 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ERVFRD-1P60508 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ERVFRD-1P60508 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ERVFRD-1P60508 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ERVFRD-1P60508 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ERVFRD-1P60508 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
ERVFRD-1P60508 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
ERVFRD-1P60508 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
ERVFRD-1P60508 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
ERVFRD-1P60508 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
ERVFRD-1P60508 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
ERVFRD-1P60508 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
ERVFRD-1P60508 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
ERVFRD-1P60508 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
ERVFRD-1P60508 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
ERVFRD-1P60508 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
ERVFRD-1P60508 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
ERVFRD-1P60508 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ERVFRD-1P60508 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ERVFRD-1P60508 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.3 ms