Protein–RNA interactions for Protein: P54707

ATP12A, Potassium-transporting ATPase alpha chain 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,039 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP12AP54707 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ATP12AP54707 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ATP12AP54707 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ATP12AP54707 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ATP12AP54707 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ATP12AP54707 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ATP12AP54707 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ATP12AP54707 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ATP12AP54707 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ATP12AP54707 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ATP12AP54707 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
ATP12AP54707 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ATP12AP54707 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ATP12AP54707 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ATP12AP54707 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
ATP12AP54707 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ATP12AP54707 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ATP12AP54707 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ATP12AP54707 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ATP12AP54707 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ATP12AP54707 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ATP12AP54707 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
ATP12AP54707 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ATP12AP54707 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
ATP12AP54707 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ATP12AP54707 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ATP12AP54707 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ATP12AP54707 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ATP12AP54707 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ATP12AP54707 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ATP12AP54707 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ATP12AP54707 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ATP12AP54707 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ATP12AP54707 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ATP12AP54707 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ATP12AP54707 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ATP12AP54707 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ATP12AP54707 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ATP12AP54707 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
ATP12AP54707 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
ATP12AP54707 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
ATP12AP54707 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
ATP12AP54707 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
ATP12AP54707 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ATP12AP54707 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ATP12AP54707 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ATP12AP54707 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ATP12AP54707 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ATP12AP54707 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
ATP12AP54707 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
ATP12AP54707 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ATP12AP54707 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ATP12AP54707 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ATP12AP54707 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ATP12AP54707 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ATP12AP54707 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ATP12AP54707 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ATP12AP54707 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
ATP12AP54707 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
ATP12AP54707 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ATP12AP54707 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ATP12AP54707 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ATP12AP54707 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ATP12AP54707 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ATP12AP54707 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ATP12AP54707 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ATP12AP54707 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ATP12AP54707 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ATP12AP54707 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ATP12AP54707 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ATP12AP54707 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ATP12AP54707 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
ATP12AP54707 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ATP12AP54707 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ATP12AP54707 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ATP12AP54707 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ATP12AP54707 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ATP12AP54707 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ATP12AP54707 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ATP12AP54707 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
ATP12AP54707 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ATP12AP54707 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ATP12AP54707 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ATP12AP54707 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ATP12AP54707 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ATP12AP54707 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ATP12AP54707 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ATP12AP54707 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ATP12AP54707 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ATP12AP54707 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ATP12AP54707 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ATP12AP54707 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ATP12AP54707 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ATP12AP54707 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ATP12AP54707 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ATP12AP54707 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ATP12AP54707 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ATP12AP54707 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ATP12AP54707 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ATP12AP54707 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 132.4 ms