Protein–RNA interactions for Protein: P53847

DSL1, Protein transport protein DSL1, yeast

Predictions only

Length 754 aa.

Protein		RNA				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	UniProt Accession	Gene	Ensembl Transcript ID	Length	Transcript Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
DSL1	P53847	AVO2	YMR068W	1281 nt		5.76	□□□□□ -1.49
DSL1	P53847	EXO1	YOR033C	2109 nt		5.76	□□□□□ -1.49
DSL1	P53847	SLD7	YOR060C	774 nt		5.76	□□□□□ -1.49
DSL1	P53847	YPR114W	YPR114W	948 nt		5.76	□□□□□ -1.49
DSL1	P53847	SIP5	YMR140W	1470 nt		5.76	□□□□□ -1.49
DSL1	P53847	IMA1	YGR287C	1770 nt		5.75	□□□□□ -1.49
DSL1	P53847	YME1	YPR024W	2244 nt		5.75	□□□□□ -1.49
DSL1	P53847	HIR1	YBL008W	2523 nt		5.75	□□□□□ -1.49
DSL1	P53847	IDP1	YDL066W	1287 nt		5.75	□□□□□ -1.49
DSL1	P53847	SIP2	YGL208W	1248 nt		5.75	□□□□□ -1.49
DSL1	P53847	HAP2	YGL237C	798 nt		5.75	□□□□□ -1.49
DSL1	P53847	GUA1	YMR217W	1578 nt		5.75	□□□□□ -1.49
DSL1	P53847	HSP78	YDR258C	2436 nt		5.75	□□□□□ -1.49
DSL1	P53847	ELP2	YGR200C	2367 nt		5.74	□□□□□ -1.49
DSL1	P53847	CDC34	YDR054C	888 nt		5.74	□□□□□ -1.49
DSL1	P53847	YGL185C	YGL185C	1140 nt		5.74	□□□□□ -1.49
DSL1	P53847	MPC2	YHR162W	390 nt		5.74	□□□□□ -1.49
DSL1	P53847	TAL1	YLR354C	1008 nt		5.74	□□□□□ -1.49
DSL1	P53847	FSF1	YOR271C	984 nt		5.74	□□□□□ -1.49
DSL1	P53847	MCM3	YEL032W	2916 nt		5.74	□□□□□ -1.49
DSL1	P53847	MDM31	YHR194W	1740 nt		5.74	□□□□□ -1.49
DSL1	P53847	YER186C	YER186C	921 nt		5.73	□□□□□ -1.49
DSL1	P53847	HAP3	YBL021C	435 nt		5.73	□□□□□ -1.49
DSL1	P53847	OCA5	YHL029C	2040 nt		5.72	□□□□□ -1.49
DSL1	P53847	BNA5	YLR231C	1362 nt		5.72	□□□□□ -1.49
DSL1	P53847	YER148W-A	YER148W-A	579 nt		5.72	□□□□□ -1.49
DSL1	P53847	ATP1	YBL099W	1638 nt		5.72	□□□□□ -1.49
DSL1	P53847	ATG7	YHR171W	1893 nt		5.72	□□□□□ -1.49
DSL1	P53847	SOG2	YOR353C	2376 nt		5.72	□□□□□ -1.49
DSL1	P53847	ATG4	YNL223W	1485 nt		5.71	□□□□□ -1.49
DSL1	P53847	ARN2	YHL047C	1863 nt		5.71	□□□□□ -1.5
DSL1	P53847	YPK2	YMR104C	2034 nt		5.71	□□□□□ -1.5
DSL1	P53847	YET3	YDL072C	612 nt		5.71	□□□□□ -1.5
DSL1	P53847	YDR187C	YDR187C	519 nt		5.71	□□□□□ -1.5
DSL1	P53847	GRX4	YER174C	735 nt		5.71	□□□□□ -1.5
DSL1	P53847	YNL019C	YNL019C	855 nt		5.71	□□□□□ -1.5
DSL1	P53847	YNL033W	YNL033W	855 nt		5.71	□□□□□ -1.5
DSL1	P53847	MDY2	YOL111C	639 nt		5.71	□□□□□ -1.5
DSL1	P53847	ECM33	YBR078W	1290 nt		5.71	□□□□□ -1.5
DSL1	P53847	RET1	YOR207C	3450 nt		5.71	□□□□□ -1.5
DSL1	P53847	UBA2	YDR390C	1911 nt		5.7	□□□□□ -1.5
DSL1	P53847	MAK31	YCR020C-A	267 nt		5.7	□□□□□ -1.5
DSL1	P53847	YDR034W-B	YDR034W-B	156 nt		5.7	□□□□□ -1.5
DSL1	P53847	RPS2	YGL123W	765 nt		5.7	□□□□□ -1.5
DSL1	P53847	CKA2	YOR061W	1020 nt		5.7	□□□□□ -1.5
DSL1	P53847	YPR196W	YPR196W	1413 nt		5.7	□□□□□ -1.5
DSL1	P53847	ASF2	YDL197C	1578 nt		5.69	□□□□□ -1.5
DSL1	P53847	RME1	YGR044C	903 nt		5.69	□□□□□ -1.5
DSL1	P53847	YIR017W-A	YIR017W-A	600 nt		5.69	□□□□□ -1.5
DSL1	P53847	VPS24	YKL041W	675 nt		5.69	□□□□□ -1.5
DSL1	P53847	YLR361C-A	YLR361C-A	297 nt		5.69	□□□□□ -1.5
DSL1	P53847	FRE3	YOR381W	2136 nt		5.69	□□□□□ -1.5
DSL1	P53847	NUD1	YOR373W	2556 nt		5.68	□□□□□ -1.5
DSL1	P53847	DRS1	YLL008W	2259 nt		5.68	□□□□□ -1.5
DSL1	P53847	TUP1	YCR084C	2142 nt		5.68	□□□□□ -1.5
DSL1	P53847	SEC39	YLR440C	2130 nt		5.68	□□□□□ -1.5
DSL1	P53847	URA3	YEL021W	804 nt		5.68	□□□□□ -1.5
DSL1	P53847	SNZ3	YFL059W	897 nt		5.68	□□□□□ -1.5
DSL1	P53847	YJR085C	YJR085C	318 nt		5.68	□□□□□ -1.5
DSL1	P53847	YEH1	YLL012W	1722 nt		5.68	□□□□□ -1.5
DSL1	P53847	DIA3	YDL024C	1407 nt		5.67	□□□□□ -1.5
DSL1	P53847	PSE1	YMR308C	3270 nt		5.67	□□□□□ -1.5
DSL1	P53847	PMT2	YAL023C	2280 nt		5.67	□□□□□ -1.5
DSL1	P53847	PDE1	YGL248W	1110 nt		5.67	□□□□□ -1.5
DSL1	P53847	DBP8	YHR169W	1296 nt		5.67	□□□□□ -1.5
DSL1	P53847	PRS1	YKL181W	1284 nt		5.67	□□□□□ -1.5
DSL1	P53847	YLR317W	YLR317W	435 nt		5.67	□□□□□ -1.5
DSL1	P53847	CAF40	YNL288W	1122 nt		5.67	□□□□□ -1.5
DSL1	P53847	SSK22	YCR073C	3996 nt		5.67	□□□□□ -1.5
DSL1	P53847	ASH1	YKL185W	1767 nt		5.66	□□□□□ -1.5
DSL1	P53847	YDL057W	YDL057W	987 nt		5.66	□□□□□ -1.5
DSL1	P53847	TFG2	YGR005C	1203 nt		5.66	□□□□□ -1.5
DSL1	P53847	HOR7	YMR251W-A	180 nt		5.66	□□□□□ -1.5
DSL1	P53847	RFA1	YAR007C	1866 nt		5.66	□□□□□ -1.5
DSL1	P53847	SMF2	YHR050W	1650 nt		5.66	□□□□□ -1.5
DSL1	P53847	HSF1	YGL073W	2502 nt		5.66	□□□□□ -1.5
DSL1	P53847	SNF3	YDL194W	2655 nt		5.65	□□□□□ -1.5
DSL1	P53847	HAP1	YLR256W	4509 nt		5.65	□□□□□ -1.5
DSL1	P53847	ENT2	YLR206W	1842 nt		5.65	□□□□□ -1.5
DSL1	P53847	SUP19	tS(UGA)E	82 nt		5.65	□□□□□ -1.5
DSL1	P53847	SUP17	tS(UGA)I	82 nt		5.65	□□□□□ -1.5
DSL1	P53847	SUP16	tS(UGA)P	82 nt		5.65	□□□□□ -1.5
DSL1	P53847	YMR122C	YMR122C	375 nt		5.65	□□□□□ -1.5
DSL1	P53847	DPH2	YKL191W	1605 nt		5.65	□□□□□ -1.51
DSL1	P53847	YRF1-4	YLR466W	4149 nt		5.65	□□□□□ -1.51
DSL1	P53847	RAD24	YER173W	1980 nt		5.64	□□□□□ -1.51
DSL1	P53847	SPC97	YHR172W	2472 nt		5.64	□□□□□ -1.51
DSL1	P53847	ICL1	YER065C	1674 nt		5.64	□□□□□ -1.51
DSL1	P53847	UGX2	YDL169C	672 nt		5.64	□□□□□ -1.51
DSL1	P53847	YDR015C	YDR015C	240 nt		5.64	□□□□□ -1.51
DSL1	P53847	YKL107W	YKL107W	930 nt		5.64	□□□□□ -1.51
DSL1	P53847	YML012C-A	YML012C-A	378 nt		5.64	□□□□□ -1.51
DSL1	P53847	RHO2	YNL090W	579 nt		5.64	□□□□□ -1.51
DSL1	P53847	SNZ2	YNL333W	897 nt		5.64	□□□□□ -1.51
DSL1	P53847	PKC1	YBL105C	3456 nt		5.64	□□□□□ -1.51
DSL1	P53847	SIA1	YOR137C	1869 nt		5.64	□□□□□ -1.51
DSL1	P53847	HEM3	YDL205C	984 nt		5.63	□□□□□ -1.51
DSL1	P53847	KSS1	YGR040W	1107 nt		5.63	□□□□□ -1.51
DSL1	P53847	COS6	YGR295C	1146 nt		5.63	□□□□□ -1.51
DSL1	P53847	YIL067C	YIL067C	2037 nt		5.63	□□□□□ -1.51

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