Protein–RNA interactions for Protein: P53671

LIMK2, LIM domain kinase 2, humanhuman

Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIMK2P53671 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
LIMK2P53671 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
LIMK2P53671 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
LIMK2P53671 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
LIMK2P53671 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
LIMK2P53671 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
LIMK2P53671 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
LIMK2P53671 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
LIMK2P53671 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
LIMK2P53671 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
LIMK2P53671 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
LIMK2P53671 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
LIMK2P53671 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
LIMK2P53671 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
LIMK2P53671 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
LIMK2P53671 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
LIMK2P53671 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
LIMK2P53671 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
LIMK2P53671 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
LIMK2P53671 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
LIMK2P53671 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
LIMK2P53671 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
LIMK2P53671 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
LIMK2P53671 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
LIMK2P53671 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
LIMK2P53671 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
LIMK2P53671 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
LIMK2P53671 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
LIMK2P53671 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
LIMK2P53671 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
LIMK2P53671 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
LIMK2P53671 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
LIMK2P53671 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
LIMK2P53671 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
LIMK2P53671 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
LIMK2P53671 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
LIMK2P53671 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
LIMK2P53671 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
LIMK2P53671 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
LIMK2P53671 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
LIMK2P53671 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
LIMK2P53671 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC23.73■■□□□ 1.39
LIMK2P53671 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
LIMK2P53671 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
LIMK2P53671 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
LIMK2P53671 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
LIMK2P53671 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
LIMK2P53671 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
LIMK2P53671 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
LIMK2P53671 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
LIMK2P53671 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
LIMK2P53671 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
LIMK2P53671 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
LIMK2P53671 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
LIMK2P53671 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
LIMK2P53671 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
LIMK2P53671 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
LIMK2P53671 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
LIMK2P53671 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
LIMK2P53671 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
LIMK2P53671 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
LIMK2P53671 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
LIMK2P53671 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
LIMK2P53671 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
LIMK2P53671 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
LIMK2P53671 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
LIMK2P53671 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
LIMK2P53671 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
LIMK2P53671 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
LIMK2P53671 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
LIMK2P53671 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
LIMK2P53671 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
LIMK2P53671 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
LIMK2P53671 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
LIMK2P53671 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
LIMK2P53671 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
LIMK2P53671 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
LIMK2P53671 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
LIMK2P53671 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
LIMK2P53671 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
LIMK2P53671 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
LIMK2P53671 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
LIMK2P53671 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
LIMK2P53671 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
LIMK2P53671 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
LIMK2P53671 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
LIMK2P53671 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
LIMK2P53671 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
LIMK2P53671 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
LIMK2P53671 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
LIMK2P53671 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
LIMK2P53671 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
LIMK2P53671 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
LIMK2P53671 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
LIMK2P53671 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
LIMK2P53671 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
LIMK2P53671 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
LIMK2P53671 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
LIMK2P53671 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
LIMK2P53671 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.7 ms