Protein–RNA interactions for Protein: P52738

ZNF140, Zinc finger protein 140, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF140P52738 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ZNF140P52738 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ZNF140P52738 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ZNF140P52738 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ZNF140P52738 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ZNF140P52738 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ZNF140P52738 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ZNF140P52738 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ZNF140P52738 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ZNF140P52738 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ZNF140P52738 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ZNF140P52738 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ZNF140P52738 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ZNF140P52738 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ZNF140P52738 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
ZNF140P52738 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ZNF140P52738 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ZNF140P52738 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ZNF140P52738 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ZNF140P52738 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ZNF140P52738 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ZNF140P52738 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ZNF140P52738 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ZNF140P52738 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ZNF140P52738 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ZNF140P52738 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
ZNF140P52738 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
ZNF140P52738 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ZNF140P52738 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
ZNF140P52738 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ZNF140P52738 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ZNF140P52738 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ZNF140P52738 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ZNF140P52738 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ZNF140P52738 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ZNF140P52738 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ZNF140P52738 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ZNF140P52738 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ZNF140P52738 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ZNF140P52738 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ZNF140P52738 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ZNF140P52738 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ZNF140P52738 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ZNF140P52738 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ZNF140P52738 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ZNF140P52738 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ZNF140P52738 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ZNF140P52738 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ZNF140P52738 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ZNF140P52738 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ZNF140P52738 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ZNF140P52738 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ZNF140P52738 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ZNF140P52738 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ZNF140P52738 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ZNF140P52738 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ZNF140P52738 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ZNF140P52738 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ZNF140P52738 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ZNF140P52738 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ZNF140P52738 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ZNF140P52738 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ZNF140P52738 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ZNF140P52738 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ZNF140P52738 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ZNF140P52738 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
ZNF140P52738 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ZNF140P52738 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ZNF140P52738 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
ZNF140P52738 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ZNF140P52738 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ZNF140P52738 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ZNF140P52738 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ZNF140P52738 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ZNF140P52738 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ZNF140P52738 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
ZNF140P52738 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ZNF140P52738 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ZNF140P52738 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ZNF140P52738 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
ZNF140P52738 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ZNF140P52738 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ZNF140P52738 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ZNF140P52738 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ZNF140P52738 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ZNF140P52738 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ZNF140P52738 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ZNF140P52738 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ZNF140P52738 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
ZNF140P52738 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ZNF140P52738 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ZNF140P52738 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ZNF140P52738 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ZNF140P52738 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ZNF140P52738 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
ZNF140P52738 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ZNF140P52738 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ZNF140P52738 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ZNF140P52738 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ZNF140P52738 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms