Protein–RNA interactions for Protein: P51955

NEK2, Serine/threonine-protein kinase Nek2, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEK2P51955 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NEK2P51955 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
NEK2P51955 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NEK2P51955 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NEK2P51955 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NEK2P51955 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NEK2P51955 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NEK2P51955 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NEK2P51955 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NEK2P51955 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NEK2P51955 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NEK2P51955 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NEK2P51955 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NEK2P51955 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NEK2P51955 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NEK2P51955 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NEK2P51955 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NEK2P51955 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NEK2P51955 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NEK2P51955 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NEK2P51955 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NEK2P51955 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
NEK2P51955 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NEK2P51955 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NEK2P51955 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NEK2P51955 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NEK2P51955 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NEK2P51955 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NEK2P51955 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NEK2P51955 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NEK2P51955 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NEK2P51955 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NEK2P51955 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
NEK2P51955 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NEK2P51955 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NEK2P51955 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NEK2P51955 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NEK2P51955 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NEK2P51955 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NEK2P51955 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
NEK2P51955 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NEK2P51955 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NEK2P51955 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NEK2P51955 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NEK2P51955 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NEK2P51955 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NEK2P51955 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NEK2P51955 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NEK2P51955 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NEK2P51955 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NEK2P51955 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NEK2P51955 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NEK2P51955 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NEK2P51955 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NEK2P51955 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NEK2P51955 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
NEK2P51955 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NEK2P51955 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NEK2P51955 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NEK2P51955 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NEK2P51955 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NEK2P51955 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NEK2P51955 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NEK2P51955 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NEK2P51955 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
NEK2P51955 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NEK2P51955 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NEK2P51955 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NEK2P51955 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NEK2P51955 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NEK2P51955 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NEK2P51955 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NEK2P51955 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NEK2P51955 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NEK2P51955 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NEK2P51955 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
NEK2P51955 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NEK2P51955 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NEK2P51955 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NEK2P51955 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NEK2P51955 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NEK2P51955 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NEK2P51955 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NEK2P51955 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NEK2P51955 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NEK2P51955 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NEK2P51955 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NEK2P51955 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NEK2P51955 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NEK2P51955 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NEK2P51955 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NEK2P51955 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NEK2P51955 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NEK2P51955 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NEK2P51955 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NEK2P51955 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NEK2P51955 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NEK2P51955 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NEK2P51955 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NEK2P51955 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39 ms