Protein–RNA interactions for Protein: P51685

CCR8, C-C chemokine receptor type 8, humanhuman

Predictions only

Length 355 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCR8P51685 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CCR8P51685 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCR8P51685 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCR8P51685 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCR8P51685 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CCR8P51685 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCR8P51685 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCR8P51685 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCR8P51685 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCR8P51685 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCR8P51685 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCR8P51685 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCR8P51685 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCR8P51685 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCR8P51685 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCR8P51685 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
CCR8P51685 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCR8P51685 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCR8P51685 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCR8P51685 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
CCR8P51685 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
CCR8P51685 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
CCR8P51685 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCR8P51685 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCR8P51685 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCR8P51685 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCR8P51685 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCR8P51685 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCR8P51685 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
CCR8P51685 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCR8P51685 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCR8P51685 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCR8P51685 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCR8P51685 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCR8P51685 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCR8P51685 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCR8P51685 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCR8P51685 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCR8P51685 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCR8P51685 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCR8P51685 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
CCR8P51685 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCR8P51685 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCR8P51685 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCR8P51685 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCR8P51685 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCR8P51685 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCR8P51685 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCR8P51685 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCR8P51685 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCR8P51685 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCR8P51685 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCR8P51685 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCR8P51685 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
CCR8P51685 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCR8P51685 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCR8P51685 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCR8P51685 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCR8P51685 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCR8P51685 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCR8P51685 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCR8P51685 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCR8P51685 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCR8P51685 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCR8P51685 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCR8P51685 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCR8P51685 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCR8P51685 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
CCR8P51685 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
CCR8P51685 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CCR8P51685 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCR8P51685 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCR8P51685 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCR8P51685 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
CCR8P51685 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCR8P51685 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCR8P51685 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCR8P51685 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCR8P51685 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCR8P51685 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCR8P51685 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCR8P51685 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCR8P51685 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCR8P51685 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCR8P51685 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCR8P51685 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCR8P51685 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCR8P51685 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
CCR8P51685 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCR8P51685 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCR8P51685 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCR8P51685 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCR8P51685 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCR8P51685 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCR8P51685 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCR8P51685 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCR8P51685 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCR8P51685 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCR8P51685 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCR8P51685 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms