Protein–RNA interactions for Protein: P49247

RPIA, Ribose-5-phosphate isomerase, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPIAP49247 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RPIAP49247 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RPIAP49247 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RPIAP49247 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RPIAP49247 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RPIAP49247 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RPIAP49247 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
RPIAP49247 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
RPIAP49247 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RPIAP49247 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RPIAP49247 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RPIAP49247 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RPIAP49247 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RPIAP49247 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RPIAP49247 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
RPIAP49247 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RPIAP49247 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RPIAP49247 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RPIAP49247 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RPIAP49247 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RPIAP49247 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RPIAP49247 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RPIAP49247 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RPIAP49247 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RPIAP49247 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RPIAP49247 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RPIAP49247 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RPIAP49247 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RPIAP49247 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RPIAP49247 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RPIAP49247 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RPIAP49247 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RPIAP49247 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RPIAP49247 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RPIAP49247 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RPIAP49247 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
RPIAP49247 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RPIAP49247 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RPIAP49247 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RPIAP49247 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RPIAP49247 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RPIAP49247 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RPIAP49247 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RPIAP49247 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RPIAP49247 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RPIAP49247 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
RPIAP49247 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RPIAP49247 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RPIAP49247 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RPIAP49247 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RPIAP49247 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RPIAP49247 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RPIAP49247 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RPIAP49247 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RPIAP49247 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RPIAP49247 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RPIAP49247 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RPIAP49247 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RPIAP49247 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RPIAP49247 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RPIAP49247 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
RPIAP49247 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
RPIAP49247 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RPIAP49247 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RPIAP49247 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
RPIAP49247 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RPIAP49247 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RPIAP49247 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RPIAP49247 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
RPIAP49247 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
RPIAP49247 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
RPIAP49247 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RPIAP49247 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RPIAP49247 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RPIAP49247 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
RPIAP49247 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RPIAP49247 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RPIAP49247 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RPIAP49247 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RPIAP49247 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RPIAP49247 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RPIAP49247 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RPIAP49247 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
RPIAP49247 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RPIAP49247 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RPIAP49247 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RPIAP49247 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RPIAP49247 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RPIAP49247 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RPIAP49247 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
RPIAP49247 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RPIAP49247 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RPIAP49247 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
RPIAP49247 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RPIAP49247 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RPIAP49247 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RPIAP49247 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RPIAP49247 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
RPIAP49247 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RPIAP49247 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms