Protein–RNA interactions for Protein: P47756

CAPZB, F-actin-capping protein subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 277 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPZBP47756 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CAPZBP47756 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CAPZBP47756 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CAPZBP47756 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CAPZBP47756 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CAPZBP47756 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CAPZBP47756 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
CAPZBP47756 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CAPZBP47756 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CAPZBP47756 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CAPZBP47756 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CAPZBP47756 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CAPZBP47756 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CAPZBP47756 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CAPZBP47756 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CAPZBP47756 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CAPZBP47756 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CAPZBP47756 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CAPZBP47756 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CAPZBP47756 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CAPZBP47756 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CAPZBP47756 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CAPZBP47756 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
CAPZBP47756 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CAPZBP47756 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CAPZBP47756 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CAPZBP47756 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CAPZBP47756 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CAPZBP47756 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CAPZBP47756 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CAPZBP47756 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CAPZBP47756 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CAPZBP47756 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CAPZBP47756 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CAPZBP47756 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CAPZBP47756 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CAPZBP47756 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CAPZBP47756 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CAPZBP47756 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CAPZBP47756 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CAPZBP47756 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CAPZBP47756 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CAPZBP47756 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CAPZBP47756 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CAPZBP47756 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CAPZBP47756 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CAPZBP47756 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CAPZBP47756 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CAPZBP47756 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CAPZBP47756 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CAPZBP47756 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CAPZBP47756 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CAPZBP47756 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CAPZBP47756 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CAPZBP47756 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CAPZBP47756 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CAPZBP47756 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CAPZBP47756 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CAPZBP47756 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CAPZBP47756 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CAPZBP47756 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CAPZBP47756 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CAPZBP47756 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CAPZBP47756 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CAPZBP47756 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CAPZBP47756 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CAPZBP47756 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CAPZBP47756 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
CAPZBP47756 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
CAPZBP47756 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
CAPZBP47756 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CAPZBP47756 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CAPZBP47756 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CAPZBP47756 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CAPZBP47756 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CAPZBP47756 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CAPZBP47756 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CAPZBP47756 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CAPZBP47756 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CAPZBP47756 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CAPZBP47756 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CAPZBP47756 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CAPZBP47756 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CAPZBP47756 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CAPZBP47756 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CAPZBP47756 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CAPZBP47756 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CAPZBP47756 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
CAPZBP47756 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CAPZBP47756 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CAPZBP47756 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CAPZBP47756 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CAPZBP47756 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
CAPZBP47756 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CAPZBP47756 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CAPZBP47756 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CAPZBP47756 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CAPZBP47756 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CAPZBP47756 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CAPZBP47756 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms