Protein–RNA interactions for Protein: P43354

NR4A2, Nuclear receptor subfamily 4 group A member 2, humanhuman

Predictions only

Length 598 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR4A2P43354 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
NR4A2P43354 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
NR4A2P43354 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
NR4A2P43354 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
NR4A2P43354 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
NR4A2P43354 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
NR4A2P43354 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
NR4A2P43354 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NR4A2P43354 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NR4A2P43354 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NR4A2P43354 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NR4A2P43354 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NR4A2P43354 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NR4A2P43354 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NR4A2P43354 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NR4A2P43354 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NR4A2P43354 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NR4A2P43354 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NR4A2P43354 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NR4A2P43354 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NR4A2P43354 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NR4A2P43354 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NR4A2P43354 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NR4A2P43354 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NR4A2P43354 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NR4A2P43354 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NR4A2P43354 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NR4A2P43354 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NR4A2P43354 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NR4A2P43354 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
NR4A2P43354 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
NR4A2P43354 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NR4A2P43354 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NR4A2P43354 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NR4A2P43354 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
NR4A2P43354 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
NR4A2P43354 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
NR4A2P43354 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
NR4A2P43354 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
NR4A2P43354 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NR4A2P43354 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
NR4A2P43354 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NR4A2P43354 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
NR4A2P43354 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
NR4A2P43354 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NR4A2P43354 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NR4A2P43354 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NR4A2P43354 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
NR4A2P43354 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
NR4A2P43354 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NR4A2P43354 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
NR4A2P43354 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
NR4A2P43354 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
NR4A2P43354 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
NR4A2P43354 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
NR4A2P43354 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
NR4A2P43354 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
NR4A2P43354 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
NR4A2P43354 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
NR4A2P43354 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
NR4A2P43354 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
NR4A2P43354 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
NR4A2P43354 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
NR4A2P43354 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
NR4A2P43354 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
NR4A2P43354 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
NR4A2P43354 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
NR4A2P43354 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
NR4A2P43354 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
NR4A2P43354 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
NR4A2P43354 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
NR4A2P43354 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
NR4A2P43354 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
NR4A2P43354 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
NR4A2P43354 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
NR4A2P43354 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
NR4A2P43354 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
NR4A2P43354 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
NR4A2P43354 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
NR4A2P43354 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
NR4A2P43354 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
NR4A2P43354 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
NR4A2P43354 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
NR4A2P43354 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
NR4A2P43354 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
NR4A2P43354 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
NR4A2P43354 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
NR4A2P43354 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
NR4A2P43354 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
NR4A2P43354 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
NR4A2P43354 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
NR4A2P43354 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
NR4A2P43354 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
NR4A2P43354 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
NR4A2P43354 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
NR4A2P43354 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
NR4A2P43354 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
NR4A2P43354 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
NR4A2P43354 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
NR4A2P43354 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 168.3 ms