Protein–RNA interactions for Protein: P43307

SSR1, Translocon-associated protein subunit alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSR1P43307 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SSR1P43307 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SSR1P43307 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SSR1P43307 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SSR1P43307 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SSR1P43307 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SSR1P43307 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SSR1P43307 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SSR1P43307 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
SSR1P43307 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SSR1P43307 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SSR1P43307 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SSR1P43307 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
SSR1P43307 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SSR1P43307 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SSR1P43307 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SSR1P43307 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SSR1P43307 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SSR1P43307 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SSR1P43307 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SSR1P43307 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SSR1P43307 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SSR1P43307 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SSR1P43307 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SSR1P43307 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SSR1P43307 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SSR1P43307 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SSR1P43307 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SSR1P43307 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SSR1P43307 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SSR1P43307 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
SSR1P43307 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SSR1P43307 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
SSR1P43307 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SSR1P43307 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
SSR1P43307 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
SSR1P43307 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SSR1P43307 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SSR1P43307 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SSR1P43307 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SSR1P43307 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SSR1P43307 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SSR1P43307 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SSR1P43307 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SSR1P43307 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SSR1P43307 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SSR1P43307 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SSR1P43307 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SSR1P43307 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SSR1P43307 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SSR1P43307 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
SSR1P43307 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
SSR1P43307 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SSR1P43307 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SSR1P43307 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SSR1P43307 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SSR1P43307 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SSR1P43307 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SSR1P43307 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SSR1P43307 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SSR1P43307 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SSR1P43307 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SSR1P43307 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SSR1P43307 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SSR1P43307 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SSR1P43307 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SSR1P43307 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SSR1P43307 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SSR1P43307 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SSR1P43307 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SSR1P43307 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SSR1P43307 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SSR1P43307 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SSR1P43307 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SSR1P43307 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SSR1P43307 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
SSR1P43307 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SSR1P43307 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SSR1P43307 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SSR1P43307 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SSR1P43307 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SSR1P43307 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SSR1P43307 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SSR1P43307 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SSR1P43307 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SSR1P43307 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SSR1P43307 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SSR1P43307 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SSR1P43307 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SSR1P43307 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SSR1P43307 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SSR1P43307 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SSR1P43307 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SSR1P43307 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SSR1P43307 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SSR1P43307 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SSR1P43307 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SSR1P43307 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SSR1P43307 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SSR1P43307 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.4 ms