Protein–RNA interactions for Protein: P42574

CASP3, Caspase-3, humanhuman

Predictions only

Length 277 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP3P42574 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
CASP3P42574 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CASP3P42574 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CASP3P42574 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CASP3P42574 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CASP3P42574 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CASP3P42574 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CASP3P42574 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CASP3P42574 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
CASP3P42574 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
CASP3P42574 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CASP3P42574 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CASP3P42574 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CASP3P42574 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
CASP3P42574 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CASP3P42574 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC21.95■■□□□ 1.11
CASP3P42574 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CASP3P42574 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CASP3P42574 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
CASP3P42574 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CASP3P42574 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CASP3P42574 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CASP3P42574 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CASP3P42574 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CASP3P42574 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CASP3P42574 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
CASP3P42574 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CASP3P42574 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CASP3P42574 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CASP3P42574 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CASP3P42574 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CASP3P42574 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CASP3P42574 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CASP3P42574 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CASP3P42574 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CASP3P42574 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CASP3P42574 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CASP3P42574 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CASP3P42574 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CASP3P42574 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CASP3P42574 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CASP3P42574 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CASP3P42574 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CASP3P42574 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CASP3P42574 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CASP3P42574 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CASP3P42574 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CASP3P42574 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CASP3P42574 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CASP3P42574 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CASP3P42574 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CASP3P42574 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CASP3P42574 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CASP3P42574 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CASP3P42574 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
CASP3P42574 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
CASP3P42574 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CASP3P42574 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CASP3P42574 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CASP3P42574 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
CASP3P42574 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
CASP3P42574 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
CASP3P42574 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CASP3P42574 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CASP3P42574 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CASP3P42574 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CASP3P42574 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CASP3P42574 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CASP3P42574 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CASP3P42574 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CASP3P42574 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CASP3P42574 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CASP3P42574 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CASP3P42574 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CASP3P42574 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CASP3P42574 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CASP3P42574 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CASP3P42574 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
CASP3P42574 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CASP3P42574 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CASP3P42574 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CASP3P42574 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CASP3P42574 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CASP3P42574 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CASP3P42574 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CASP3P42574 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CASP3P42574 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CASP3P42574 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CASP3P42574 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CASP3P42574 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CASP3P42574 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CASP3P42574 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CASP3P42574 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CASP3P42574 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CASP3P42574 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CASP3P42574 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CASP3P42574 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CASP3P42574 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CASP3P42574 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CASP3P42574 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 161.2 ms