Protein–RNA interactions for Protein: P40818

USP8, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 8, humanhuman

Predictions only

Length 1,118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP8P40818 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
USP8P40818 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
USP8P40818 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
USP8P40818 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
USP8P40818 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
USP8P40818 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
USP8P40818 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
USP8P40818 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
USP8P40818 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
USP8P40818 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
USP8P40818 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
USP8P40818 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
USP8P40818 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
USP8P40818 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
USP8P40818 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
USP8P40818 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
USP8P40818 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
USP8P40818 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
USP8P40818 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
USP8P40818 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
USP8P40818 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
USP8P40818 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
USP8P40818 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
USP8P40818 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
USP8P40818 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
USP8P40818 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
USP8P40818 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
USP8P40818 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
USP8P40818 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
USP8P40818 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
USP8P40818 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
USP8P40818 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
USP8P40818 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
USP8P40818 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
USP8P40818 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
USP8P40818 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
USP8P40818 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
USP8P40818 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.67
USP8P40818 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
USP8P40818 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
USP8P40818 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
USP8P40818 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
USP8P40818 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
USP8P40818 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
USP8P40818 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
USP8P40818 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
USP8P40818 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
USP8P40818 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
USP8P40818 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
USP8P40818 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
USP8P40818 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
USP8P40818 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
USP8P40818 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
USP8P40818 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
USP8P40818 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
USP8P40818 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
USP8P40818 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
USP8P40818 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
USP8P40818 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
USP8P40818 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
USP8P40818 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
USP8P40818 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
USP8P40818 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
USP8P40818 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
USP8P40818 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
USP8P40818 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
USP8P40818 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
USP8P40818 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
USP8P40818 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
USP8P40818 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
USP8P40818 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
USP8P40818 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
USP8P40818 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
USP8P40818 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
USP8P40818 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
USP8P40818 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
USP8P40818 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
USP8P40818 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
USP8P40818 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
USP8P40818 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
USP8P40818 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
USP8P40818 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
USP8P40818 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
USP8P40818 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
USP8P40818 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
USP8P40818 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
USP8P40818 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
USP8P40818 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC25.39■■□□□ 1.66
USP8P40818 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
USP8P40818 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
USP8P40818 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
USP8P40818 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
USP8P40818 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
USP8P40818 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
USP8P40818 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
USP8P40818 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
USP8P40818 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
USP8P40818 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
USP8P40818 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
USP8P40818 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms