Protein–RNA interactions for Protein: P35900

KRT20, Keratin, type I cytoskeletal 20, humanhuman

Predictions only

Length 424 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT20P35900 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
KRT20P35900 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
KRT20P35900 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
KRT20P35900 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
KRT20P35900 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
KRT20P35900 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
KRT20P35900 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
KRT20P35900 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
KRT20P35900 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
KRT20P35900 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
KRT20P35900 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
KRT20P35900 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
KRT20P35900 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
KRT20P35900 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
KRT20P35900 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
KRT20P35900 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
KRT20P35900 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
KRT20P35900 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
KRT20P35900 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KRT20P35900 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KRT20P35900 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KRT20P35900 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KRT20P35900 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
KRT20P35900 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
KRT20P35900 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KRT20P35900 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
KRT20P35900 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
KRT20P35900 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
KRT20P35900 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
KRT20P35900 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KRT20P35900 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
KRT20P35900 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KRT20P35900 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
KRT20P35900 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KRT20P35900 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
KRT20P35900 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
KRT20P35900 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
KRT20P35900 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
KRT20P35900 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
KRT20P35900 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
KRT20P35900 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
KRT20P35900 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
KRT20P35900 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
KRT20P35900 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
KRT20P35900 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
KRT20P35900 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
KRT20P35900 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
KRT20P35900 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
KRT20P35900 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
KRT20P35900 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
KRT20P35900 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
KRT20P35900 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
KRT20P35900 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
KRT20P35900 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
KRT20P35900 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
KRT20P35900 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
KRT20P35900 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
KRT20P35900 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
KRT20P35900 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KRT20P35900 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KRT20P35900 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KRT20P35900 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KRT20P35900 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KRT20P35900 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
KRT20P35900 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
KRT20P35900 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KRT20P35900 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KRT20P35900 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KRT20P35900 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
KRT20P35900 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KRT20P35900 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
KRT20P35900 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
KRT20P35900 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
KRT20P35900 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
KRT20P35900 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
KRT20P35900 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
KRT20P35900 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
KRT20P35900 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
KRT20P35900 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
KRT20P35900 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
KRT20P35900 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
KRT20P35900 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
KRT20P35900 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
KRT20P35900 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
KRT20P35900 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
KRT20P35900 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
KRT20P35900 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
KRT20P35900 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
KRT20P35900 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
KRT20P35900 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KRT20P35900 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KRT20P35900 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KRT20P35900 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KRT20P35900 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
KRT20P35900 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KRT20P35900 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KRT20P35900 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KRT20P35900 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KRT20P35900 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
KRT20P35900 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms