Protein–RNA interactions for Protein: P35523

CLCN1, Chloride channel protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 988 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLCN1P35523 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CLCN1P35523 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CLCN1P35523 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CLCN1P35523 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CLCN1P35523 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CLCN1P35523 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CLCN1P35523 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CLCN1P35523 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
CLCN1P35523 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CLCN1P35523 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CLCN1P35523 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CLCN1P35523 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CLCN1P35523 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CLCN1P35523 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CLCN1P35523 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CLCN1P35523 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
CLCN1P35523 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
CLCN1P35523 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
CLCN1P35523 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CLCN1P35523 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CLCN1P35523 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
CLCN1P35523 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CLCN1P35523 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
CLCN1P35523 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CLCN1P35523 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CLCN1P35523 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CLCN1P35523 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CLCN1P35523 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CLCN1P35523 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CLCN1P35523 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CLCN1P35523 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CLCN1P35523 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CLCN1P35523 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CLCN1P35523 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CLCN1P35523 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CLCN1P35523 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CLCN1P35523 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CLCN1P35523 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CLCN1P35523 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CLCN1P35523 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CLCN1P35523 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CLCN1P35523 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CLCN1P35523 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CLCN1P35523 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CLCN1P35523 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CLCN1P35523 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CLCN1P35523 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CLCN1P35523 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CLCN1P35523 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CLCN1P35523 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CLCN1P35523 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CLCN1P35523 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
CLCN1P35523 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
CLCN1P35523 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CLCN1P35523 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
CLCN1P35523 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CLCN1P35523 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
CLCN1P35523 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
CLCN1P35523 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
CLCN1P35523 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
CLCN1P35523 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CLCN1P35523 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CLCN1P35523 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
CLCN1P35523 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CLCN1P35523 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CLCN1P35523 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CLCN1P35523 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CLCN1P35523 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CLCN1P35523 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CLCN1P35523 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CLCN1P35523 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CLCN1P35523 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CLCN1P35523 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CLCN1P35523 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CLCN1P35523 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CLCN1P35523 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CLCN1P35523 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CLCN1P35523 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CLCN1P35523 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CLCN1P35523 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CLCN1P35523 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CLCN1P35523 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CLCN1P35523 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CLCN1P35523 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CLCN1P35523 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CLCN1P35523 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CLCN1P35523 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CLCN1P35523 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
CLCN1P35523 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CLCN1P35523 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CLCN1P35523 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CLCN1P35523 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CLCN1P35523 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CLCN1P35523 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
CLCN1P35523 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CLCN1P35523 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
CLCN1P35523 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CLCN1P35523 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CLCN1P35523 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CLCN1P35523 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.9 ms