Protein–RNA interactions for Protein: P32969

RPL9, 60S ribosomal protein L9, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 192 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL9P32969 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
RPL9P32969 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RPL9P32969 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RPL9P32969 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RPL9P32969 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RPL9P32969 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RPL9P32969 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RPL9P32969 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
RPL9P32969 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RPL9P32969 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC25.37■■□□□ 1.65
RPL9P32969 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
RPL9P32969 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RPL9P32969 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RPL9P32969 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
RPL9P32969 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
RPL9P32969 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
RPL9P32969 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RPL9P32969 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
RPL9P32969 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
RPL9P32969 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RPL9P32969 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RPL9P32969 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RPL9P32969 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RPL9P32969 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RPL9P32969 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RPL9P32969 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
RPL9P32969 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
RPL9P32969 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RPL9P32969 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RPL9P32969 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
RPL9P32969 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RPL9P32969 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RPL9P32969 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
RPL9P32969 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RPL9P32969 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
RPL9P32969 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
RPL9P32969 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
RPL9P32969 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
RPL9P32969 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
RPL9P32969 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
RPL9P32969 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
RPL9P32969 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RPL9P32969 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RPL9P32969 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RPL9P32969 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
RPL9P32969 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
RPL9P32969 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC25.32■■□□□ 1.64
RPL9P32969 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
RPL9P32969 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
RPL9P32969 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RPL9P32969 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RPL9P32969 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RPL9P32969 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
RPL9P32969 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RPL9P32969 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
RPL9P32969 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
RPL9P32969 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RPL9P32969 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
RPL9P32969 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
RPL9P32969 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
RPL9P32969 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
RPL9P32969 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RPL9P32969 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RPL9P32969 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RPL9P32969 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RPL9P32969 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RPL9P32969 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RPL9P32969 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RPL9P32969 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RPL9P32969 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RPL9P32969 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RPL9P32969 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RPL9P32969 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RPL9P32969 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
RPL9P32969 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
RPL9P32969 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RPL9P32969 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
RPL9P32969 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
RPL9P32969 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
RPL9P32969 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
RPL9P32969 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC25.27■■□□□ 1.64
RPL9P32969 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
RPL9P32969 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RPL9P32969 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
RPL9P32969 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RPL9P32969 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RPL9P32969 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
RPL9P32969 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC25.26■■□□□ 1.63
RPL9P32969 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
RPL9P32969 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RPL9P32969 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RPL9P32969 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RPL9P32969 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RPL9P32969 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
RPL9P32969 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
RPL9P32969 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RPL9P32969 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
RPL9P32969 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RPL9P32969 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
RPL9P32969 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.7 ms