Protein–RNA interactions for Protein: P22223

CDH3, Cadherin-3, humanhuman

Predictions only

Length 829 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH3P22223 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CDH3P22223 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CDH3P22223 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CDH3P22223 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
CDH3P22223 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CDH3P22223 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CDH3P22223 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CDH3P22223 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CDH3P22223 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
CDH3P22223 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CDH3P22223 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CDH3P22223 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CDH3P22223 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CDH3P22223 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CDH3P22223 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CDH3P22223 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CDH3P22223 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CDH3P22223 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CDH3P22223 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CDH3P22223 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CDH3P22223 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CDH3P22223 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CDH3P22223 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CDH3P22223 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CDH3P22223 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CDH3P22223 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CDH3P22223 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CDH3P22223 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
CDH3P22223 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CDH3P22223 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CDH3P22223 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CDH3P22223 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CDH3P22223 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CDH3P22223 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
CDH3P22223 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CDH3P22223 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CDH3P22223 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CDH3P22223 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CDH3P22223 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CDH3P22223 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CDH3P22223 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CDH3P22223 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
CDH3P22223 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CDH3P22223 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CDH3P22223 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CDH3P22223 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CDH3P22223 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CDH3P22223 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
CDH3P22223 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CDH3P22223 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CDH3P22223 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CDH3P22223 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CDH3P22223 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CDH3P22223 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CDH3P22223 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CDH3P22223 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
CDH3P22223 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CDH3P22223 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CDH3P22223 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CDH3P22223 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CDH3P22223 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CDH3P22223 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CDH3P22223 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CDH3P22223 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CDH3P22223 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
CDH3P22223 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CDH3P22223 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CDH3P22223 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CDH3P22223 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CDH3P22223 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CDH3P22223 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CDH3P22223 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CDH3P22223 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CDH3P22223 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CDH3P22223 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CDH3P22223 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
CDH3P22223 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CDH3P22223 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CDH3P22223 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CDH3P22223 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CDH3P22223 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CDH3P22223 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CDH3P22223 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
CDH3P22223 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CDH3P22223 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CDH3P22223 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CDH3P22223 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CDH3P22223 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CDH3P22223 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CDH3P22223 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
CDH3P22223 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CDH3P22223 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CDH3P22223 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CDH3P22223 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CDH3P22223 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CDH3P22223 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CDH3P22223 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CDH3P22223 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
CDH3P22223 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CDH3P22223 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.2 ms