Protein–RNA interactions for Protein: P20393

NR1D1, Nuclear receptor subfamily 1 group D member 1, humanhuman

Predictions only

Length 614 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR1D1P20393 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NR1D1P20393 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NR1D1P20393 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NR1D1P20393 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NR1D1P20393 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NR1D1P20393 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
NR1D1P20393 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
NR1D1P20393 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC24.2■■□□□ 1.47
NR1D1P20393 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
NR1D1P20393 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NR1D1P20393 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
NR1D1P20393 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NR1D1P20393 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NR1D1P20393 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
NR1D1P20393 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
NR1D1P20393 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NR1D1P20393 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NR1D1P20393 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NR1D1P20393 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NR1D1P20393 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NR1D1P20393 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NR1D1P20393 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NR1D1P20393 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NR1D1P20393 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NR1D1P20393 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NR1D1P20393 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NR1D1P20393 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NR1D1P20393 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NR1D1P20393 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NR1D1P20393 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NR1D1P20393 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NR1D1P20393 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NR1D1P20393 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NR1D1P20393 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NR1D1P20393 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NR1D1P20393 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NR1D1P20393 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NR1D1P20393 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NR1D1P20393 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NR1D1P20393 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NR1D1P20393 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NR1D1P20393 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NR1D1P20393 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NR1D1P20393 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NR1D1P20393 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NR1D1P20393 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NR1D1P20393 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
NR1D1P20393 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NR1D1P20393 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NR1D1P20393 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NR1D1P20393 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NR1D1P20393 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
NR1D1P20393 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NR1D1P20393 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NR1D1P20393 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NR1D1P20393 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NR1D1P20393 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NR1D1P20393 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NR1D1P20393 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NR1D1P20393 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NR1D1P20393 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NR1D1P20393 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
NR1D1P20393 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NR1D1P20393 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NR1D1P20393 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NR1D1P20393 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NR1D1P20393 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
NR1D1P20393 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
NR1D1P20393 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
NR1D1P20393 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
NR1D1P20393 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
NR1D1P20393 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
NR1D1P20393 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
NR1D1P20393 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
NR1D1P20393 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NR1D1P20393 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NR1D1P20393 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NR1D1P20393 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NR1D1P20393 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NR1D1P20393 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NR1D1P20393 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NR1D1P20393 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NR1D1P20393 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NR1D1P20393 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NR1D1P20393 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NR1D1P20393 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NR1D1P20393 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NR1D1P20393 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NR1D1P20393 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NR1D1P20393 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NR1D1P20393 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NR1D1P20393 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NR1D1P20393 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NR1D1P20393 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NR1D1P20393 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NR1D1P20393 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NR1D1P20393 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NR1D1P20393 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NR1D1P20393 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NR1D1P20393 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms