Protein–RNA interactions for Protein: P19397

CD53, Leukocyte surface antigen CD53, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD53P19397 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CD53P19397 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CD53P19397 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CD53P19397 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CD53P19397 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC21.3■■□□□ 1
CD53P19397 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CD53P19397 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CD53P19397 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CD53P19397 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CD53P19397 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CD53P19397 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CD53P19397 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CD53P19397 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CD53P19397 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC21.29■■□□□ 1
CD53P19397 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
CD53P19397 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CD53P19397 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC21.28■■□□□ 1
CD53P19397 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CD53P19397 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CD53P19397 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CD53P19397 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CD53P19397 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CD53P19397 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CD53P19397 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CD53P19397 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CD53P19397 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CD53P19397 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CD53P19397 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CD53P19397 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CD53P19397 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CD53P19397 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CD53P19397 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC21.27■■□□□ 1
CD53P19397 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC21.27■■□□□ 1
CD53P19397 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CD53P19397 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CD53P19397 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CD53P19397 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
CD53P19397 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CD53P19397 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CD53P19397 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CD53P19397 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CD53P19397 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CD53P19397 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CD53P19397 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CD53P19397 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
CD53P19397 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CD53P19397 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CD53P19397 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CD53P19397 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CD53P19397 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CD53P19397 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
CD53P19397 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CD53P19397 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CD53P19397 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CD53P19397 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CD53P19397 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CD53P19397 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
CD53P19397 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CD53P19397 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CD53P19397 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CD53P19397 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CD53P19397 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CD53P19397 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CD53P19397 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CD53P19397 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CD53P19397 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CD53P19397 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
CD53P19397 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CD53P19397 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
CD53P19397 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CD53P19397 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CD53P19397 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
CD53P19397 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CD53P19397 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CD53P19397 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CD53P19397 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CD53P19397 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CD53P19397 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CD53P19397 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CD53P19397 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CD53P19397 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CD53P19397 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CD53P19397 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CD53P19397 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
CD53P19397 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CD53P19397 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CD53P19397 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CD53P19397 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CD53P19397 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CD53P19397 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CD53P19397 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CD53P19397 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CD53P19397 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CD53P19397 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CD53P19397 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CD53P19397 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CD53P19397 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CD53P19397 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CD53P19397 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CD53P19397 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.9 ms