Protein–RNA interactions for Protein: P19388

POLR2E, DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2EP19388 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
POLR2EP19388 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
POLR2EP19388 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
POLR2EP19388 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
POLR2EP19388 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
POLR2EP19388 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
POLR2EP19388 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
POLR2EP19388 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
POLR2EP19388 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
POLR2EP19388 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
POLR2EP19388 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
POLR2EP19388 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
POLR2EP19388 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
POLR2EP19388 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
POLR2EP19388 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
POLR2EP19388 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
POLR2EP19388 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
POLR2EP19388 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
POLR2EP19388 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
POLR2EP19388 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
POLR2EP19388 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
POLR2EP19388 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
POLR2EP19388 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
POLR2EP19388 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC24.09■■□□□ 1.45
POLR2EP19388 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
POLR2EP19388 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
POLR2EP19388 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
POLR2EP19388 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
POLR2EP19388 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
POLR2EP19388 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
POLR2EP19388 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
POLR2EP19388 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
POLR2EP19388 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
POLR2EP19388 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
POLR2EP19388 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
POLR2EP19388 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
POLR2EP19388 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
POLR2EP19388 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
POLR2EP19388 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
POLR2EP19388 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC24.07■■□□□ 1.44
POLR2EP19388 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
POLR2EP19388 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
POLR2EP19388 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
POLR2EP19388 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
POLR2EP19388 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
POLR2EP19388 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
POLR2EP19388 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
POLR2EP19388 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
POLR2EP19388 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
POLR2EP19388 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
POLR2EP19388 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
POLR2EP19388 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
POLR2EP19388 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
POLR2EP19388 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC24.05■■□□□ 1.44
POLR2EP19388 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
POLR2EP19388 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
POLR2EP19388 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
POLR2EP19388 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
POLR2EP19388 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
POLR2EP19388 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
POLR2EP19388 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
POLR2EP19388 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
POLR2EP19388 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
POLR2EP19388 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
POLR2EP19388 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC24.04■■□□□ 1.44
POLR2EP19388 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
POLR2EP19388 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
POLR2EP19388 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
POLR2EP19388 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
POLR2EP19388 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
POLR2EP19388 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
POLR2EP19388 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
POLR2EP19388 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
POLR2EP19388 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
POLR2EP19388 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
POLR2EP19388 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
POLR2EP19388 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
POLR2EP19388 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
POLR2EP19388 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
POLR2EP19388 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
POLR2EP19388 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC24.02■■□□□ 1.44
POLR2EP19388 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
POLR2EP19388 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
POLR2EP19388 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
POLR2EP19388 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
POLR2EP19388 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
POLR2EP19388 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.43
POLR2EP19388 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
POLR2EP19388 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
POLR2EP19388 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
POLR2EP19388 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
POLR2EP19388 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
POLR2EP19388 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
POLR2EP19388 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
POLR2EP19388 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
POLR2EP19388 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
POLR2EP19388 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
POLR2EP19388 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
POLR2EP19388 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
POLR2EP19388 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms