Protein–RNA interactions for Protein: P17661

DES, Desmin, humanhuman

Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DESP17661 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
DESP17661 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
DESP17661 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
DESP17661 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
DESP17661 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
DESP17661 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
DESP17661 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
DESP17661 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
DESP17661 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
DESP17661 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
DESP17661 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
DESP17661 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
DESP17661 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
DESP17661 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
DESP17661 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
DESP17661 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
DESP17661 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
DESP17661 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
DESP17661 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
DESP17661 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
DESP17661 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
DESP17661 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
DESP17661 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
DESP17661 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
DESP17661 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
DESP17661 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
DESP17661 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
DESP17661 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
DESP17661 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
DESP17661 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
DESP17661 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
DESP17661 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
DESP17661 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
DESP17661 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
DESP17661 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
DESP17661 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
DESP17661 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
DESP17661 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
DESP17661 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
DESP17661 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
DESP17661 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
DESP17661 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
DESP17661 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
DESP17661 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
DESP17661 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
DESP17661 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
DESP17661 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
DESP17661 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
DESP17661 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
DESP17661 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
DESP17661 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
DESP17661 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
DESP17661 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
DESP17661 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
DESP17661 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
DESP17661 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
DESP17661 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
DESP17661 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
DESP17661 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
DESP17661 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
DESP17661 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
DESP17661 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
DESP17661 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
DESP17661 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
DESP17661 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
DESP17661 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
DESP17661 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
DESP17661 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
DESP17661 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
DESP17661 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
DESP17661 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
DESP17661 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
DESP17661 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
DESP17661 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
DESP17661 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
DESP17661 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
DESP17661 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
DESP17661 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
DESP17661 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
DESP17661 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
DESP17661 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
DESP17661 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
DESP17661 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
DESP17661 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
DESP17661 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
DESP17661 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
DESP17661 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
DESP17661 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
DESP17661 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
DESP17661 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
DESP17661 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
DESP17661 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
DESP17661 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
DESP17661 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
DESP17661 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
DESP17661 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
DESP17661 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
DESP17661 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
DESP17661 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
DESP17661 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.6 ms