Protein–RNA interactions for Protein: P12110

COL6A2, Collagen alpha-2(VI) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,019 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL6A2P12110 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
COL6A2P12110 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
COL6A2P12110 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
COL6A2P12110 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
COL6A2P12110 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
COL6A2P12110 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
COL6A2P12110 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
COL6A2P12110 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
COL6A2P12110 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
COL6A2P12110 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
COL6A2P12110 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
COL6A2P12110 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
COL6A2P12110 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
COL6A2P12110 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
COL6A2P12110 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
COL6A2P12110 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
COL6A2P12110 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
COL6A2P12110 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
COL6A2P12110 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
COL6A2P12110 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
COL6A2P12110 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
COL6A2P12110 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
COL6A2P12110 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
COL6A2P12110 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
COL6A2P12110 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
COL6A2P12110 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
COL6A2P12110 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
COL6A2P12110 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
COL6A2P12110 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
COL6A2P12110 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
COL6A2P12110 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
COL6A2P12110 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
COL6A2P12110 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
COL6A2P12110 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
COL6A2P12110 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
COL6A2P12110 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
COL6A2P12110 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
COL6A2P12110 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
COL6A2P12110 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
COL6A2P12110 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
COL6A2P12110 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC23.27■■□□□ 1.32
COL6A2P12110 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
COL6A2P12110 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
COL6A2P12110 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
COL6A2P12110 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
COL6A2P12110 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
COL6A2P12110 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
COL6A2P12110 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
COL6A2P12110 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
COL6A2P12110 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
COL6A2P12110 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
COL6A2P12110 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
COL6A2P12110 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
COL6A2P12110 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
COL6A2P12110 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
COL6A2P12110 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
COL6A2P12110 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
COL6A2P12110 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
COL6A2P12110 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
COL6A2P12110 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
COL6A2P12110 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
COL6A2P12110 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
COL6A2P12110 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
COL6A2P12110 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
COL6A2P12110 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
COL6A2P12110 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
COL6A2P12110 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
COL6A2P12110 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
COL6A2P12110 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
COL6A2P12110 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
COL6A2P12110 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
COL6A2P12110 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
COL6A2P12110 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
COL6A2P12110 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
COL6A2P12110 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
COL6A2P12110 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
COL6A2P12110 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
COL6A2P12110 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
COL6A2P12110 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
COL6A2P12110 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
COL6A2P12110 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
COL6A2P12110 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
COL6A2P12110 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
COL6A2P12110 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
COL6A2P12110 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
COL6A2P12110 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
COL6A2P12110 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
COL6A2P12110 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
COL6A2P12110 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
COL6A2P12110 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
COL6A2P12110 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
COL6A2P12110 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
COL6A2P12110 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
COL6A2P12110 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
COL6A2P12110 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
COL6A2P12110 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
COL6A2P12110 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
COL6A2P12110 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
COL6A2P12110 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
COL6A2P12110 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms