Protein–RNA interactions for Protein: P11474

ESRRA, Steroid hormone receptor ERR1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 423 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ESRRAP11474 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ESRRAP11474 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ESRRAP11474 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ESRRAP11474 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ESRRAP11474 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ESRRAP11474 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ESRRAP11474 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ESRRAP11474 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ESRRAP11474 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ESRRAP11474 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ESRRAP11474 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ESRRAP11474 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ESRRAP11474 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ESRRAP11474 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ESRRAP11474 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ESRRAP11474 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ESRRAP11474 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ESRRAP11474 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ESRRAP11474 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ESRRAP11474 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ESRRAP11474 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ESRRAP11474 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ESRRAP11474 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ESRRAP11474 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ESRRAP11474 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ESRRAP11474 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ESRRAP11474 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ESRRAP11474 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ESRRAP11474 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ESRRAP11474 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ESRRAP11474 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ESRRAP11474 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ESRRAP11474 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ESRRAP11474 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ESRRAP11474 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
ESRRAP11474 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ESRRAP11474 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ESRRAP11474 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ESRRAP11474 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ESRRAP11474 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
ESRRAP11474 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ESRRAP11474 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ESRRAP11474 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ESRRAP11474 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ESRRAP11474 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ESRRAP11474 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ESRRAP11474 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ESRRAP11474 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ESRRAP11474 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ESRRAP11474 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ESRRAP11474 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ESRRAP11474 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ESRRAP11474 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ESRRAP11474 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ESRRAP11474 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ESRRAP11474 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ESRRAP11474 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ESRRAP11474 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ESRRAP11474 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ESRRAP11474 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ESRRAP11474 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ESRRAP11474 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ESRRAP11474 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ESRRAP11474 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ESRRAP11474 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ESRRAP11474 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ESRRAP11474 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ESRRAP11474 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ESRRAP11474 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ESRRAP11474 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ESRRAP11474 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ESRRAP11474 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
ESRRAP11474 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ESRRAP11474 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ESRRAP11474 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ESRRAP11474 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ESRRAP11474 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ESRRAP11474 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ESRRAP11474 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ESRRAP11474 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ESRRAP11474 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ESRRAP11474 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ESRRAP11474 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ESRRAP11474 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ESRRAP11474 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ESRRAP11474 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ESRRAP11474 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ESRRAP11474 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ESRRAP11474 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ESRRAP11474 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ESRRAP11474 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ESRRAP11474 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ESRRAP11474 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
ESRRAP11474 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
ESRRAP11474 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ESRRAP11474 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ESRRAP11474 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ESRRAP11474 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ESRRAP11474 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ESRRAP11474 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms