Protein–RNA interactions for Protein: P09341

CXCL1, Growth-regulated alpha protein, humanhuman

Predictions only

Length 107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL1P09341 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
CXCL1P09341 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CXCL1P09341 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CXCL1P09341 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CXCL1P09341 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CXCL1P09341 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CXCL1P09341 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CXCL1P09341 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CXCL1P09341 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CXCL1P09341 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CXCL1P09341 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CXCL1P09341 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CXCL1P09341 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CXCL1P09341 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CXCL1P09341 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CXCL1P09341 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CXCL1P09341 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CXCL1P09341 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CXCL1P09341 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
CXCL1P09341 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CXCL1P09341 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CXCL1P09341 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CXCL1P09341 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CXCL1P09341 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CXCL1P09341 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CXCL1P09341 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CXCL1P09341 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CXCL1P09341 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CXCL1P09341 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CXCL1P09341 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CXCL1P09341 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CXCL1P09341 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CXCL1P09341 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CXCL1P09341 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CXCL1P09341 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CXCL1P09341 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CXCL1P09341 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CXCL1P09341 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CXCL1P09341 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CXCL1P09341 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CXCL1P09341 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CXCL1P09341 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CXCL1P09341 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CXCL1P09341 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CXCL1P09341 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CXCL1P09341 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CXCL1P09341 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CXCL1P09341 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CXCL1P09341 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CXCL1P09341 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
CXCL1P09341 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
CXCL1P09341 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CXCL1P09341 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CXCL1P09341 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CXCL1P09341 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CXCL1P09341 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CXCL1P09341 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CXCL1P09341 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CXCL1P09341 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CXCL1P09341 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CXCL1P09341 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CXCL1P09341 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CXCL1P09341 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CXCL1P09341 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CXCL1P09341 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CXCL1P09341 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CXCL1P09341 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CXCL1P09341 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CXCL1P09341 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CXCL1P09341 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CXCL1P09341 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CXCL1P09341 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CXCL1P09341 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CXCL1P09341 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
CXCL1P09341 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CXCL1P09341 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
CXCL1P09341 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CXCL1P09341 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CXCL1P09341 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
CXCL1P09341 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CXCL1P09341 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CXCL1P09341 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CXCL1P09341 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CXCL1P09341 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CXCL1P09341 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CXCL1P09341 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CXCL1P09341 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
CXCL1P09341 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CXCL1P09341 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CXCL1P09341 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CXCL1P09341 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CXCL1P09341 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CXCL1P09341 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CXCL1P09341 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CXCL1P09341 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CXCL1P09341 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CXCL1P09341 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CXCL1P09341 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CXCL1P09341 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CXCL1P09341 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.1 ms