Protein–RNA interactions for Protein: P08579

SNRPB2, U2 small nuclear ribonucleoprotein B'', humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 225 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNRPB2P08579 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
SNRPB2P08579 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SNRPB2P08579 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SNRPB2P08579 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SNRPB2P08579 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SNRPB2P08579 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SNRPB2P08579 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SNRPB2P08579 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SNRPB2P08579 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SNRPB2P08579 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SNRPB2P08579 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SNRPB2P08579 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SNRPB2P08579 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SNRPB2P08579 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SNRPB2P08579 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SNRPB2P08579 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SNRPB2P08579 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SNRPB2P08579 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SNRPB2P08579 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SNRPB2P08579 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SNRPB2P08579 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SNRPB2P08579 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SNRPB2P08579 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SNRPB2P08579 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SNRPB2P08579 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SNRPB2P08579 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SNRPB2P08579 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SNRPB2P08579 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SNRPB2P08579 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SNRPB2P08579 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SNRPB2P08579 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SNRPB2P08579 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SNRPB2P08579 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SNRPB2P08579 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SNRPB2P08579 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SNRPB2P08579 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SNRPB2P08579 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SNRPB2P08579 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SNRPB2P08579 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
SNRPB2P08579 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SNRPB2P08579 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SNRPB2P08579 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SNRPB2P08579 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SNRPB2P08579 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.23
SNRPB2P08579 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
SNRPB2P08579 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
SNRPB2P08579 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SNRPB2P08579 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SNRPB2P08579 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SNRPB2P08579 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SNRPB2P08579 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SNRPB2P08579 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SNRPB2P08579 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SNRPB2P08579 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SNRPB2P08579 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SNRPB2P08579 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SNRPB2P08579 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SNRPB2P08579 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SNRPB2P08579 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SNRPB2P08579 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SNRPB2P08579 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SNRPB2P08579 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SNRPB2P08579 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SNRPB2P08579 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SNRPB2P08579 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SNRPB2P08579 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SNRPB2P08579 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SNRPB2P08579 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SNRPB2P08579 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SNRPB2P08579 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SNRPB2P08579 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SNRPB2P08579 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SNRPB2P08579 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SNRPB2P08579 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SNRPB2P08579 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SNRPB2P08579 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SNRPB2P08579 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SNRPB2P08579 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SNRPB2P08579 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SNRPB2P08579 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SNRPB2P08579 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SNRPB2P08579 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SNRPB2P08579 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SNRPB2P08579 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SNRPB2P08579 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SNRPB2P08579 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SNRPB2P08579 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SNRPB2P08579 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SNRPB2P08579 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SNRPB2P08579 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SNRPB2P08579 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SNRPB2P08579 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SNRPB2P08579 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SNRPB2P08579 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SNRPB2P08579 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SNRPB2P08579 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SNRPB2P08579 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SNRPB2P08579 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SNRPB2P08579 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SNRPB2P08579 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.1 ms