Protein–RNA interactions for Protein: P07333

CSF1R, Macrophage colony-stimulating factor 1 receptor, humanhuman

Predictions only

Length 972 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSF1RP07333 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
CSF1RP07333 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
CSF1RP07333 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
CSF1RP07333 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
CSF1RP07333 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
CSF1RP07333 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC29.44■■■□□ 2.3
CSF1RP07333 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
CSF1RP07333 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
CSF1RP07333 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
CSF1RP07333 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
CSF1RP07333 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
CSF1RP07333 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
CSF1RP07333 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
CSF1RP07333 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
CSF1RP07333 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
CSF1RP07333 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
CSF1RP07333 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
CSF1RP07333 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
CSF1RP07333 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
CSF1RP07333 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
CSF1RP07333 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
CSF1RP07333 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
CSF1RP07333 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
CSF1RP07333 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
CSF1RP07333 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
CSF1RP07333 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
CSF1RP07333 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
CSF1RP07333 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
CSF1RP07333 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
CSF1RP07333 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
CSF1RP07333 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
CSF1RP07333 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
CSF1RP07333 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC29.4■■■□□ 2.3
CSF1RP07333 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC29.4■■■□□ 2.3
CSF1RP07333 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
CSF1RP07333 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC29.4■■■□□ 2.3
CSF1RP07333 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
CSF1RP07333 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
CSF1RP07333 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
CSF1RP07333 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
CSF1RP07333 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
CSF1RP07333 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
CSF1RP07333 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC29.39■■■□□ 2.3
CSF1RP07333 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
CSF1RP07333 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
CSF1RP07333 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
CSF1RP07333 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
CSF1RP07333 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.29
CSF1RP07333 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
CSF1RP07333 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
CSF1RP07333 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
CSF1RP07333 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
CSF1RP07333 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
CSF1RP07333 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
CSF1RP07333 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
CSF1RP07333 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
CSF1RP07333 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
CSF1RP07333 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
CSF1RP07333 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
CSF1RP07333 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
CSF1RP07333 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
CSF1RP07333 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC29.36■■■□□ 2.29
CSF1RP07333 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC29.36■■■□□ 2.29
CSF1RP07333 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
CSF1RP07333 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
CSF1RP07333 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
CSF1RP07333 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
CSF1RP07333 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
CSF1RP07333 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
CSF1RP07333 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
CSF1RP07333 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC29.35■■■□□ 2.29
CSF1RP07333 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC29.35■■■□□ 2.29
CSF1RP07333 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
CSF1RP07333 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
CSF1RP07333 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC29.34■■■□□ 2.29
CSF1RP07333 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
CSF1RP07333 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
CSF1RP07333 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
CSF1RP07333 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
CSF1RP07333 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
CSF1RP07333 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
CSF1RP07333 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
CSF1RP07333 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
CSF1RP07333 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
CSF1RP07333 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
CSF1RP07333 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
CSF1RP07333 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
CSF1RP07333 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
CSF1RP07333 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC29.32■■■□□ 2.28
CSF1RP07333 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
CSF1RP07333 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC29.32■■■□□ 2.28
CSF1RP07333 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
CSF1RP07333 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
CSF1RP07333 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
CSF1RP07333 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
CSF1RP07333 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
CSF1RP07333 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
CSF1RP07333 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
CSF1RP07333 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
CSF1RP07333 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms